matrin-3 Plásmido CRISPR/Cas9 KO (h): sc-418085

Descripción general

MATR3 codifica la matrin-3, una proteína de la matriz nuclear con capacidad de unión a ARN/ADN que se asocia con la lámina nuclear y la cromatina para sostener la arquitectura nuclear y la organización del genoma. Matrin-3 participa en el procesamiento de ARN, incluido el empalme (splicing) del pre-ARNm, la estabilización del ARNm y la regulación de la expresión génica mediante interacciones con complejos ribonucleoproteicos. Sus funciones se solapan con vías que gobiernan la organización nucleocitoplasmática, las respuestas al daño del ADN y la dinámica de los gránulos de estrés, vinculando a MATR3 con la proteostasis y la homeostasis del ARN en neuronas. La desregulación o las mutaciones de MATR3 se han asociado con fenotipos neurodegenerativos, incluidos trastornos del espectro ELA/DFT, lo que lo hace relevante para estudios de disfunción de proteínas de unión a ARN y defectos estructurales nucleares.

El plásmido CRISPR/Cas9 KO matrin-3 (h) es un conjunto de plásmidos diseñado para la interrupción dirigida del gen MATR3 en líneas celulares human. Cada plásmido coexpresa un ARN guía único (sgRNA) dirigido a un sitio distinto dentro del MATR3 junto con la nucleasa Cas9 de Streptococcus pyogenes. Los plásmidos también codifican GFP, lo que permite la identificación fluorescente y el enriquecimiento de las células transfectadas con éxito mediante microscopía de fluorescencia o citometría de flujo.

El diseño multiguía aumenta la probabilidad de generar inserciones o deleciones (indeles) que interrumpan el marco de lectura abierto de MATR3 tras la formación de roturas de doble cadena mediadas por Cas9. Las roturas de ADN introducidas por el sistema CRISPR/Cas9 se reparan a través de vías endógenas de unión de extremos no homólogos (NHEJ), lo que con frecuencia da lugar a mutaciones de desplazamiento del marco de lectura que anulan la expresión de la proteína matrin-3.

Este sistema de knockout CRISPR permite la generación eficiente de modelos celulares deficientes en MATR3 para la investigación de la señalización de matrin-3, estudios de genómica funcional, investigación en biología del cáncer y evaluación de respuestas terapéuticas en líneas celulares humanas.

Características principales

• sgRNA dirigidos a los exones de MATR3 críticos para la función de matrin-3
  Coexpresión de SpCas9 y sgRNA a partir de un único plásmido para simplificar la administración
  Reportero GFP para la identificación de células transfectadas
  Conjunto de plásmidos dirigidos a múltiples sitios genómicos de MATR3 para mejorar la eficiencia del knockout
  Compatible con la administración mediante transfección

Variantes de diseño

CRISPRs +/- HDRs

• Los gRNA codificados por el plásmido matrin-3 CRISPR/Cas9 KO (h) y el plásmido matrin-3 CRISPR/Cas9 KO (h2) se dirigen a sitios distintos dentro del locus MATR3. Puede estar disponible uno o ambos diseños de orientación. Consulte «Productos relacionados» para conocer la disponibilidad.
  Las construcciones donantes HDR codificadas por el plásmido HDR matrin-3 (h) y el plásmido HDR matrin-3 (h2) contienen un casete de resistencia a la puromicina y un reportero RFP flanqueado por brazos de homología MATR3 para facilitar la reparación dirigida por homología en sitios diana MATR3 definidos que se corresponden con los diseños de KO de CRISPR/Cas9. La disponibilidad de los donantes HDR puede variar. Consulte «Productos relacionados» para conocer la disponibilidad.

Sólo para uso en investigación. No destinado a uso diagnóstico o terapéutico.