MAP LC3γ Plásmido CRISPR/Cas9 KO (h): sc-406161

Descripción general

MAP1LC3C codifica la cadena ligera 3 gamma de las proteínas asociadas a microtúbulos 1A/1B (MAP LC3γ), un miembro de la familia ATG8 tipo ubiquitina que se lipida y se incorpora a las membranas de los autofagosomas durante la autofagia. LC3γ participa en la biogénesis del autofagosoma, el reconocimiento de carga mediante motivos de región de interacción con LC3 (LIR) y la coordinación del flujo autofágico con la degradación lisosomal, conectando la detección de nutrientes con las respuestas al estrés celular. A través de su papel en la proteostasis y el control de calidad de orgánulos, MAP1LC3C es relevante para vías implicadas en el metabolismo de células cancerosas, la neurodegeneración y la señalización inflamatoria, donde la autofagia alterada puede modular la supervivencia y las respuestas de la inmunidad innata. El estudio de MAP LC3γ ayuda a dilucidar contribuciones específicas de isoforma a la autofagia selectiva, incluida la mitofagia y la xenofagia, y los efectos posteriores en las decisiones sobre el destino celular.

El plásmido CRISPR/Cas9 KO MAP LC3γ (h) es un conjunto de plásmidos diseñado para la interrupción selectiva del gen MAP1LC3C en líneas celulares human. Cada plásmido del conjunto coexpresa un ARN guía específico (sgRNA) único, dirigido a un sitio distinto dentro del locus MAP1LC3C, junto con la nucleasa Cas9 de Streptococcus pyogenes, y codifica GFP para permitir la identificación fluorescente y el enriquecimiento de las células transfectadas con éxito. Esta estrategia multiguía aumenta la probabilidad de inducir desplazamientos de marco de lectura o deleciones que produzcan una inactivación funcional, ofreciendo una alternativa más robusta a los enfoques de guía única. Las DSB inducidas en múltiples sitios se resuelven mediante unión de extremos no homólogos (NHEJ) o, cuando se utiliza con la plantilla donante HDR incluida, mediante reparación dirigida por homología (HDR) en un sitio diana definido dentro del locus.

Cuando se utiliza junto con el donante HDR que expresa RFP, la fluorescencia de GFP y RFP puede utilizarse conjuntamente para distinguir las poblaciones de células transfectadas de las editadas, lo que agiliza los flujos de trabajo de clasificación y selección de clones basados en citometría de flujo.

Donante de reparación dirigida por homología (HDR) — Casete de puromicina con reportero RFP

Para aplicaciones que requieren clones knockout confirmados y seleccionables, el plásmido HDR MAP LC3γ (h) incluye un constructo donante HDR que contiene un casete de resistencia a la puromicina (PuroR) y un reportero de proteína fluorescente roja (RFP), flanqueado por brazos de homología específicos de un sitio diana definido MAP1LC3C.
Cuando se cotransfecciona con el plásmido MAP LC3γ CRISPR/Cas9 KO (h):

• El casete PuroR-RFP se integra en el sitio de corte de Cas9 mediante HDR, interrumpiendo el marco de lectura abierto MAP1LC3C.
  La fluorescencia de la RFP proporciona un indicador visual inmediato del éxito de la integración, lo que permite la identificación o clasificación basada en la fluorescencia de las células editadas antes o junto con la selección con puromicina.
  Las células editadas con éxito se confirman mediante la resistencia a la puromicina, lo que reduce sustancialmente la carga de cribado de clones.
  Esta estrategia de selección es ideal para generar líneas celulares KO clonales estables para estudios funcionales posteriores, cribado de fármacos o desarrollo de modelos.

Sistema de eliminación del casete Cre-lox

La construcción donante HDR cuenta con sitios loxP que flanquean el casete de selección PuroR-RFP para permitir la eliminación limpia del marcador tras la confirmación del clon. La expresión transitoria de la recombinasa Cre a través del vector Cre: sc-418923 incluido extirpa el casete, dejando un sitio loxP residual mínimo dentro del locus MAP1LC3C y eliminando posibles efectos de confusión en los ensayos posteriores.
Este enfoque en dos pasos:

• Minimiza la alteración de la arquitectura local de la cromatina y de los elementos reguladores vecinos
  Restaura un contexto genómico casi nativo en el locus editado
  Permite reutilizar la estrategia de selección con puromicina en la misma línea celular para ediciones adicionales

Características principales

• gRNA dirigido a los exones MAP1LC3C críticos para la función MAP LC3γ
  Coexpresión de SpCas9 y sgRNA a partir de un único plásmido para una administración simplificada
  Donante HDR con resistencia a la puromicina para la selección positiva de clones
  Casete PuroR flanqueado por loxP con vector de recombinasa Cre para la eliminación sin fisuras del marcador
  Se suministra listo para su uso mediante transfección

Sólo para uso en investigación. No destinado a uso diagnóstico o terapéutico.