IRX4 Plásmido CRISPR/Cas9 KO (h): sc-405618

Descripción general

IRX4 (Iroquois homeobox 4) codifica un factor de transcripción con homeodominio que regula programas de expresión génica espaciotemporales durante el desarrollo, con funciones destacadas en el linaje cardiaco y en otros linajes mesodérmicos. Como proteína nuclear de unión al ADN, IRX4 contribuye a redes transcripcionales que determinan decisiones de destino celular, diferenciación y patrón tisular mediante la modulación de genes diana downstream y la interacción con vías más amplias reguladas por homeobox. La expresión desregulada de IRX4 o su circuito regulador se ha implicado en alteraciones de la señalización del desarrollo y en estados transcripcionales dependientes del contexto observados en biología del cáncer, lo que la hace relevante para estudios de especificación de linaje y regulación génica asociada a enfermedad.

El plásmido CRISPR/Cas9 KO IRX4 (h) es un conjunto de plásmidos diseñado para la interrupción dirigida del gen IRX4 en líneas celulares human. Cada plásmido coexpresa un ARN guía único (sgRNA) dirigido a un sitio distinto dentro del IRX4 junto con la nucleasa Cas9 de Streptococcus pyogenes. Los plásmidos también codifican GFP, lo que permite la identificación fluorescente y el enriquecimiento de las células transfectadas con éxito mediante microscopía de fluorescencia o citometría de flujo.

El diseño multiguía aumenta la probabilidad de generar inserciones o deleciones (indeles) que interrumpan el marco de lectura abierto de IRX4 tras la formación de roturas de doble cadena mediadas por Cas9. Las roturas de ADN introducidas por el sistema CRISPR/Cas9 se reparan a través de vías endógenas de unión de extremos no homólogos (NHEJ), lo que con frecuencia da lugar a mutaciones de desplazamiento del marco de lectura que anulan la expresión de la proteína IRX4.

Este sistema de knockout CRISPR permite la generación eficiente de modelos celulares deficientes en IRX4 para la investigación de la señalización de IRX4, estudios de genómica funcional, investigación en biología del cáncer y evaluación de respuestas terapéuticas en líneas celulares humanas.

Características principales

• sgRNA dirigidos a los exones de IRX4 críticos para la función de IRX4
  Coexpresión de SpCas9 y sgRNA a partir de un único plásmido para simplificar la administración
  Reportero GFP para la identificación de células transfectadas
  Conjunto de plásmidos dirigidos a múltiples sitios genómicos de IRX4 para mejorar la eficiencia del knockout
  Compatible con la administración mediante transfección

Variantes de diseño

CRISPRs +/- HDRs

• Los gRNA codificados por el plásmido IRX4 CRISPR/Cas9 KO (h) y el plásmido IRX4 CRISPR/Cas9 KO (h2) se dirigen a sitios distintos dentro del locus IRX4. Puede estar disponible uno o ambos diseños de orientación. Consulte «Productos relacionados» para conocer la disponibilidad.
  Las construcciones donantes HDR codificadas por el plásmido HDR IRX4 (h) y el plásmido HDR IRX4 (h2) contienen un casete de resistencia a la puromicina y un reportero RFP flanqueado por brazos de homología IRX4 para facilitar la reparación dirigida por homología en sitios diana IRX4 definidos que se corresponden con los diseños de KO de CRISPR/Cas9. La disponibilidad de los donantes HDR puede variar. Consulte «Productos relacionados» para conocer la disponibilidad.

Sólo para uso en investigación. No destinado a uso diagnóstico o terapéutico.