IRX3 Plásmido CRISPR/Cas9 KO (h): sc-404632

Descripción general

IRX3 (Iroquois homeobox 3) codifica un factor de transcripción con homeobox que ayuda a establecer programas transcripcionales durante el patrón embrionario y la organogénesis, con funciones dependientes del contexto en la especificación del destino celular y la diferenciación. En células humanas, IRX3 se integra con redes de señalización del desarrollo, incluidas vías vinculadas a la señalización Wnt y BMP, para orientar decisiones de linaje y la expresión génica específica de tejido. Más allá del desarrollo, la regulación alterada de IRX3 se ha asociado con fenotipos metabólicos y cambios en la biología de los adipocitos, y se ha descrito una expresión desregulada de IRX3 en múltiples contextos de cáncer. Estas características convierten a IRX3 en un nodo útil para estudiar el control transcripcional, el estado de diferenciación y los circuitos reguladores de genes impulsados por vías de señalización.

El plásmido CRISPR/Cas9 KO IRX3 (h) es un conjunto de plásmidos diseñado para la interrupción dirigida del gen IRX3 en líneas celulares human. Cada plásmido coexpresa un ARN guía único (sgRNA) dirigido a un sitio distinto dentro del IRX3 junto con la nucleasa Cas9 de Streptococcus pyogenes. Los plásmidos también codifican GFP, lo que permite la identificación fluorescente y el enriquecimiento de las células transfectadas con éxito mediante microscopía de fluorescencia o citometría de flujo.

El diseño multiguía aumenta la probabilidad de generar inserciones o deleciones (indeles) que interrumpan el marco de lectura abierto de IRX3 tras la formación de roturas de doble cadena mediadas por Cas9. Las roturas de ADN introducidas por el sistema CRISPR/Cas9 se reparan a través de vías endógenas de unión de extremos no homólogos (NHEJ), lo que con frecuencia da lugar a mutaciones de desplazamiento del marco de lectura que anulan la expresión de la proteína IRX3.

Este sistema de knockout CRISPR permite la generación eficiente de modelos celulares deficientes en IRX3 para la investigación de la señalización de IRX3, estudios de genómica funcional, investigación en biología del cáncer y evaluación de respuestas terapéuticas en líneas celulares humanas.

Características principales

• sgRNA dirigidos a los exones de IRX3 críticos para la función de IRX3
  Coexpresión de SpCas9 y sgRNA a partir de un único plásmido para simplificar la administración
  Reportero GFP para la identificación de células transfectadas
  Conjunto de plásmidos dirigidos a múltiples sitios genómicos de IRX3 para mejorar la eficiencia del knockout
  Compatible con la administración mediante transfección

Variantes de diseño

CRISPRs +/- HDRs

• Los gRNA codificados por el plásmido IRX3 CRISPR/Cas9 KO (h) y el plásmido IRX3 CRISPR/Cas9 KO (h2) se dirigen a sitios distintos dentro del locus IRX3. Puede estar disponible uno o ambos diseños de orientación. Consulte «Productos relacionados» para conocer la disponibilidad.
  Las construcciones donantes HDR codificadas por el plásmido HDR IRX3 (h) y el plásmido HDR IRX3 (h2) contienen un casete de resistencia a la puromicina y un reportero RFP flanqueado por brazos de homología IRX3 para facilitar la reparación dirigida por homología en sitios diana IRX3 definidos que se corresponden con los diseños de KO de CRISPR/Cas9. La disponibilidad de los donantes HDR puede variar. Consulte «Productos relacionados» para conocer la disponibilidad.

Sólo para uso en investigación. No destinado a uso diagnóstico o terapéutico.