HS3ST6 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h): sc-408948

Übersicht

HS3ST6 kodiert die Heparansulfat-Glucosamin-3-O-Sulfotransferase 6, ein im Golgi-Apparat lokalisiertes Enzym, das die 3‑O‑Sulfatierung von Heparansulfat-Ketten katalysiert und dabei seltene Sulfatierungsmotive erzeugt, die Heparansulfat‑Protein‑Interaktionen prägen. Durch die Modulation der Feinstruktur von Heparansulfat-Proteoglykanen beeinflusst HS3ST6 die Ligandenbindung und die Ausbildung von Gradienten in Kontexten der extrazellulären Matrix sowie der Signalübertragung an der Zelloberfläche und wirkt sich auf Prozesse wie Zelladhäsion, Migration und rezeptorvermittelte Signalgebung aus. Veränderte Heparansulfat-Sulfatierungsmuster stehen mit einer Fehlregulation von Wachstumsfaktor- und Zytokinsignalen in Verbindung und wurden mit Tumorbiologie sowie inflammatorischen Mikroumgebungen assoziiert, wodurch HS3ST6 ein nützliches Ziel für mechanistische Studien zur glykosaminoglykanabhängigen Regulation darstellt.

Das HS3ST6 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h) ist ein Pool von Plasmiden, die für die gezielte Disruption des HS3ST6-Gens in human-Zelllinien entwickelt wurden. Jedes Plasmid koexprimiert eine einzigartige Single-Guide-RNA (sgRNA), die auf eine bestimmte Stelle innerhalb des HS3ST6-Gens abzielt, zusammen mit der Streptococcus pyogenes Cas9-Nuklease. Die Plasmide kodieren zudem für GFP, was die fluoreszente Identifizierung und Anreicherung erfolgreich transfizierter Zellen mittels Fluoreszenzmikroskopie oder Durchflusszytometrie ermöglicht.

Das Multi-Guide-Design erhöht die Wahrscheinlichkeit, dass Insertionen oder Deletionen (Indels) entstehen, die den offenen Leserahmen von HS3ST6 nach der Cas9-vermittelten Bildung von Doppelstrangbrüchen unterbrechen. Durch das CRISPR/Cas9-System verursachte DNA-Brüche werden über endogene NHEJ-Wege (Non-Homologous End Joining) repariert, was häufig zu Frameshift-Mutationen führt, die die HS3ST6-Proteinexpression aufheben.

Dieses CRISPR-Knockout-System ermöglicht die effiziente Erzeugung von HS3ST6-defizienten Zellmodellen zur Untersuchung der HS3ST6-Signalübertragung, für funktionelle Genomstudien, in der Krebsbiologieforschung sowie zur Bewertung therapeutischer Reaktionen in menschlichen Zelllinien.

Hauptmerkmale

• sgRNAs, die auf HS3ST6-Exone abzielen, die für die HS3ST6-Funktion entscheidend sind
  Ko-Expression von SpCas9 und sgRNA aus einem einzigen Plasmid zur vereinfachten Verabreichung
  GFP-Reporter zur Identifizierung transfizierter Zellen
  Pool von Plasmiden, die auf mehrere HS3ST6-Genomstellen abzielen, um die Knockout-Effizienz zu verbessern
  Kompatibel mit der Verabreichung durch Transfektion

Designvarianten

CRISPRs +/- HDRs

• gRNAs, die vom HS3ST6 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h) und vom HS3ST6 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h2) kodiert werden, zielen auf unterschiedliche Stellen innerhalb des HS3ST6-Lokus ab. Es kann ein oder beide Targeting-Designs verfügbar sein. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.
  HDR-Donorkonstrukte, kodiert durch das HS3ST6 HDR-Plasmid (h) und HS3ST6 HDR-Plasmid (h2) kodiert, enthalten eine Puromycin-Resistenzkassette und einen RFP-Reporter, flankiert von HS3ST6-Homologiearmen, um die homologe Reparatur an definierten HS3ST6-Zielstellen entsprechend den CRISPR/Cas9-KO-Designs zu unterstützen. Die Verfügbarkeit von HDR-Donoren kann variieren. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.

Nur für Forschungszwecke. Nicht für diagnostische oder therapeutische Zwecke bestimmt.