HoxB5 Plásmido CRISPR/Cas9 KO (h): sc-409631

Descripción general

HOXB5 codifica el factor de transcripción con homeobox HoxB5, un regulador de unión al ADN específico de secuencia que ayuda a establecer el patrón anteroposterior y la identidad tisular durante el desarrollo embrionario. HoxB5 participa en programas transcripcionales aguas abajo de señales morfogénicas del desarrollo, incluidas vías sensibles al ácido retinoico, para coordinar la especificación de linaje, la proliferación y la diferenciación. En contextos adultos, la expresión desregulada de HOXB5 se ha asociado con un control alterado del estado celular y con redes transcripcionales aberrantes observadas en múltiples conjuntos de datos de cáncer y de enfermedades hematopoyéticas. Como regulador nuclear, HoxB5 se estudia comúnmente para cartografiar circuitos de regulación génica, la lógica potenciador–promotor y mecanismos de reprogramación del desarrollo en modelos celulares humanos.

El plásmido CRISPR/Cas9 KO HoxB5 (h) es un conjunto de plásmidos diseñado para la interrupción dirigida del gen HOXB5 en líneas celulares human. Cada plásmido coexpresa un ARN guía único (sgRNA) dirigido a un sitio distinto dentro del HOXB5 junto con la nucleasa Cas9 de Streptococcus pyogenes. Los plásmidos también codifican GFP, lo que permite la identificación fluorescente y el enriquecimiento de las células transfectadas con éxito mediante microscopía de fluorescencia o citometría de flujo.

El diseño multiguía aumenta la probabilidad de generar inserciones o deleciones (indeles) que interrumpan el marco de lectura abierto de HOXB5 tras la formación de roturas de doble cadena mediadas por Cas9. Las roturas de ADN introducidas por el sistema CRISPR/Cas9 se reparan a través de vías endógenas de unión de extremos no homólogos (NHEJ), lo que con frecuencia da lugar a mutaciones de desplazamiento del marco de lectura que anulan la expresión de la proteína HoxB5.

Este sistema de knockout CRISPR permite la generación eficiente de modelos celulares deficientes en HOXB5 para la investigación de la señalización de HoxB5, estudios de genómica funcional, investigación en biología del cáncer y evaluación de respuestas terapéuticas en líneas celulares humanas.

Características principales

• sgRNA dirigidos a los exones de HOXB5 críticos para la función de HoxB5
  Coexpresión de SpCas9 y sgRNA a partir de un único plásmido para simplificar la administración
  Reportero GFP para la identificación de células transfectadas
  Conjunto de plásmidos dirigidos a múltiples sitios genómicos de HOXB5 para mejorar la eficiencia del knockout
  Compatible con la administración mediante transfección

Variantes de diseño

CRISPRs +/- HDRs

• Los gRNA codificados por el plásmido HoxB5 CRISPR/Cas9 KO (h) y el plásmido HoxB5 CRISPR/Cas9 KO (h2) se dirigen a sitios distintos dentro del locus HOXB5. Puede estar disponible uno o ambos diseños de orientación. Consulte «Productos relacionados» para conocer la disponibilidad.
  Las construcciones donantes HDR codificadas por el plásmido HDR HoxB5 (h) y el plásmido HDR HoxB5 (h2) contienen un casete de resistencia a la puromicina y un reportero RFP flanqueado por brazos de homología HOXB5 para facilitar la reparación dirigida por homología en sitios diana HOXB5 definidos que se corresponden con los diseños de KO de CRISPR/Cas9. La disponibilidad de los donantes HDR puede variar. Consulte «Productos relacionados» para conocer la disponibilidad.

Sólo para uso en investigación. No destinado a uso diagnóstico o terapéutico.