HoxA3 Plásmido CRISPR/Cas9 KO (h): sc-404634

Descripción general

HOXA3 codifica el factor de transcripción homeobox HoxA3, un regulador de unión al ADN específico de secuencia que establece la identidad anteroposterior durante la embriogénesis y coordina programas que gobiernan la morfogénesis, la diferenciación epitelial y la remodelación tisular. HoxA3 se integra con las redes reguladoras del clúster HOX e interactúa con vías de señalización del desarrollo como WNT, BMP/TGF-β y el ácido retinoico para moldear las decisiones de destino celular y la expresión génica espacial. En contextos adultos, la alteración de la expresión de HOXA3 o la desregulación epigenética se han asociado con estados de diferenciación aberrantes y con la reprogramación transcripcional observada en el cáncer y otros trastornos que implican la reactivación de genes del desarrollo. Como regulador nuclear, HoxA3 se estudia con frecuencia en el mapeo de redes de regulación génica, modelos de especificación de linaje y el control de la transcripción mediado por la cromatina.

El plásmido CRISPR/Cas9 KO HoxA3 (h) es un conjunto de plásmidos diseñado para la interrupción dirigida del gen HOXA3 en líneas celulares human. Cada plásmido coexpresa un ARN guía único (sgRNA) dirigido a un sitio distinto dentro del HOXA3 junto con la nucleasa Cas9 de Streptococcus pyogenes. Los plásmidos también codifican GFP, lo que permite la identificación fluorescente y el enriquecimiento de las células transfectadas con éxito mediante microscopía de fluorescencia o citometría de flujo.

El diseño multiguía aumenta la probabilidad de generar inserciones o deleciones (indeles) que interrumpan el marco de lectura abierto de HOXA3 tras la formación de roturas de doble cadena mediadas por Cas9. Las roturas de ADN introducidas por el sistema CRISPR/Cas9 se reparan a través de vías endógenas de unión de extremos no homólogos (NHEJ), lo que con frecuencia da lugar a mutaciones de desplazamiento del marco de lectura que anulan la expresión de la proteína HoxA3.

Este sistema de knockout CRISPR permite la generación eficiente de modelos celulares deficientes en HOXA3 para la investigación de la señalización de HoxA3, estudios de genómica funcional, investigación en biología del cáncer y evaluación de respuestas terapéuticas en líneas celulares humanas.

Características principales

• sgRNA dirigidos a los exones de HOXA3 críticos para la función de HoxA3
  Coexpresión de SpCas9 y sgRNA a partir de un único plásmido para simplificar la administración
  Reportero GFP para la identificación de células transfectadas
  Conjunto de plásmidos dirigidos a múltiples sitios genómicos de HOXA3 para mejorar la eficiencia del knockout
  Compatible con la administración mediante transfección

Variantes de diseño

CRISPRs +/- HDRs

• Los gRNA codificados por el plásmido HoxA3 CRISPR/Cas9 KO (h) y el plásmido HoxA3 CRISPR/Cas9 KO (h2) se dirigen a sitios distintos dentro del locus HOXA3. Puede estar disponible uno o ambos diseños de orientación. Consulte «Productos relacionados» para conocer la disponibilidad.
  Las construcciones donantes HDR codificadas por el plásmido HDR HoxA3 (h) y el plásmido HDR HoxA3 (h2) contienen un casete de resistencia a la puromicina y un reportero RFP flanqueado por brazos de homología HOXA3 para facilitar la reparación dirigida por homología en sitios diana HOXA3 definidos que se corresponden con los diseños de KO de CRISPR/Cas9. La disponibilidad de los donantes HDR puede variar. Consulte «Productos relacionados» para conocer la disponibilidad.

Sólo para uso en investigación. No destinado a uso diagnóstico o terapéutico.