Plasmide CRISPR/Cas9 KO HCF1 (h): sc-403097

Présentation

HCFC1 code le facteur de cellule hôte 1 (HCF1), un co-régulateur transcriptionnel associé à la chromatine qui fait le lien entre des facteurs de transcription spécifiques de séquence et des complexes de modification des histones afin de coordonner les programmes d’expression génique nécessaires à la progression du cycle cellulaire et à l’identité cellulaire. HCF1 participe au contrôle épigénétique des promoteurs et des enhancers, en soutenant des voies liées à la transition G1/S, à l’acquisition de la compétence de réplication de l’ADN et à l’homéostasie transcriptionnelle. Une altération de la fonction de HCFC1 a été impliquée dans des phénotypes neurodéveloppementaux et dans la déficience intellectuelle liée à l’X, et des réseaux transcriptionnels dépendants de HCF1 modifiés sont également étudiés dans le contexte de la prolifération oncogénique. En tant que nœud central du remodelage de la chromatine et de l’assemblage de facteurs de transcription, HCF1 est fréquemment exploré dans des études portant sur la régulation des promoteurs, le contrôle du cycle cellulaire et les circuits d’expression génique à l’échelle du génome.

Le plasmide CRISPR/Cas9 KO HCF1 (h) est un ensemble de plasmides conçus pour la disruption ciblée du gène HCFC1 dans les lignées cellulaires human. Chaque plasmide co-exprime un ARN guide unique (sgRNA) ciblant un site distinct au sein du HCFC1, ainsi que la nucléase Cas9 de Streptococcus pyogenes. Les plasmides codent également pour la GFP, ce qui permet l'identification par fluorescence et l'enrichissement des cellules transfectées avec succès par microscopie à fluorescence ou cytométrie en flux.

La conception multi-guide augmente la probabilité de générer des insertions ou des délétions (indels) qui perturbent le cadre de lecture ouvert HCFC1 à la suite de la formation de cassures double brin médiées par Cas9. Les cassures d'ADN introduites par le système CRISPR/Cas9 sont réparées par des voies endogènes de jonction non homologue (NHEJ), ce qui entraîne fréquemment des mutations par décalage du cadre de lecture qui suppriment l'expression de la protéine HCF1.

Ce système de knock-out CRISPR permet la génération efficace de modèles cellulaires déficients en HCFC1 pour l'étude de la signalisation de HCF1, les études de génomique fonctionnelle, la recherche en biologie du cancer et l'évaluation des réponses thérapeutiques dans des lignées cellulaires humaines.

Caractéristiques principales

• sgRNA ciblant le ou les exons de HCFC1 essentiels à la fonction de HCF1
  Co-expression de SpCas9 et de sgRNA à partir d'un seul plasmide pour une administration simplifiée
  Rapporteur GFP pour l'identification des cellules transfectées
  Pool de plasmides ciblant plusieurs sites génomiques de HCFC1 pour améliorer l'efficacité du knock-out
  Compatible avec l'administration par transfection

Variantes de conception

CRISPR +/- HDR

• Les gRNA codés par le HCF1 plasmide CRISPR/Cas9 KO (h) et le HCF1 plasmide CRISPR/Cas9 KO (h2) ciblent des sites distincts au sein du locus HCFC1. Une ou les deux conceptions de ciblage peuvent être disponibles. Voir les produits associés pour connaître la disponibilité.
  Les constructions donneuses HDR codées par le HCF1 plasmide HDR (h) et le HCF1 (h2) contiennent une cassette de résistance à la puromycine et un rapporteur RFP flanqué de bras d'homologie HCFC1 pour permettre la réparation dirigée par homologie au niveau de sites cibles HCFC1 définis correspondant aux conceptions CRISPR/Cas9 KO. La disponibilité des donneurs HDR peut varier. Voir les produits associés pour connaître la disponibilité.

Réservé à la recherche. N'est pas destiné à un usage diagnostique ou thérapeutique.