HCF1 CRISPR/Cas9 KOプラスミド (h): sc-403097

概要

HCFC1は、クロマチンに結合する転写共調節因子であるホストセルファクター1（HCF1）をコードする。HCF1は、配列特異的転写因子とヒストン修飾複合体をつなぐ役割を担い、細胞周期の進行や細胞アイデンティティの維持に必要な遺伝子発現プログラムを協調的に制御する。HCF1はプロモーターおよびエンハンサーのエピジェネティック制御に関与し、G1/S移行、DNA複製能の獲得、転写恒常性に関連する経路を支える。HCFC1機能の破綻は神経発達関連の表現型やX連鎖知的障害との関連が示唆されており、HCF1依存的な転写ネットワークの変化は腫瘍性増殖の文脈でも研究されている。クロマチンリモデリングと転写因子複合体形成の要所として、HCF1はプロモーター制御、細胞周期制御、ゲノムワイドな遺伝子発現回路に関する研究で頻繁に解析対象となる。

HCF1 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）は、human細胞株におけるHCFC1遺伝子の標的破壊を目的として設計されたプラスミドのプールである。各プラスミドは、HCFC1内の異なる部位を標的とする固有のシングルガイドRNA（sgRNA）と、Streptococcus pyogenes由来のCas9ヌクレアーゼを共発現します。また、これらのプラスミドはGFPをコードしており、蛍光顕微鏡やフローサイトメトリーを用いて、トランスフェクションに成功した細胞を蛍光で識別・濃縮することが可能です。

このマルチガイド設計により、Cas9による二本鎖切断の形成後に、HCFC1のオープンリーディングフレームを破壊する挿入または欠失（インデル）が生じる可能性が高まります。CRISPR/Cas9システムによって導入されたDNA切断は、内因性の非相同末端結合（NHEJ）経路を通じて修復され、その結果、HCF1タンパク質の発現を阻害するフレームシフト変異が生じることが頻繁にあります。

このCRISPRノックアウトシステムにより、HCF1シグナル伝達、機能ゲノミクス研究、がん生物学研究、およびヒト細胞株における治療反応の評価を目的とした、HCFC1欠損細胞モデルの効率的な作製が可能となる。

主な特徴

• HCF1の機能に不可欠なHCFC1エクソンを標的とするsgRNA
  導入を簡素化するための、単一プラスミドからのSpCas9およびsgRNAの共発現
  トランスフェクトされた細胞を識別するためのGFPレポーター
  ノックアウト効率を向上させるための、HCFC1ゲノム上の複数の部位を標的とするプラスミドのプール
  トランスフェクションによる導入に対応

設計バリエーション

CRISPRs +/- HDR

• HCF1 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）およびHCF1 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h2）によってコードされるgRNAは、HCFC1遺伝子座内の異なる部位を標的としています。いずれか一方、または両方の標的設計が利用可能な場合があります。入手可能性については「関連製品」を参照してください。
  HCF1 HDRプラスミド（h）および HCF1 HDRプラスミド（h2）によってコードされるHDRドナー構築体は、プロマイシン耐性カセットとRFPレポーターを含み、これらはHCFC1ホモロジーアームに挟まれており、CRISPR/Cas9 KO設計に対応する特定のHCFC1標的部位でのホモロジー依存修復をサポートします。HDRドナーの入手可能性は異なる場合があります。入手可能性については「関連製品」をご確認ください。

研究用のみ。診断用または治療用ではありません。