GalNAc-T13 Plásmido CRISPR/Cas9 KO (h): sc-407103

Descripción general

GALNT13 codifica la polipeptídica N-acetilgalactosaminiltransferasa 13 (GalNAc-T13), una enzima iniciadora residente en el aparato de Golgi para la O-glicosilación de tipo mucina que transfiere GalNAc a residuos de serina/treonina en proteínas secretoras y de membrana nacientes. Al moldear los patrones de O-glicanos en receptores, moléculas de adhesión y mucinas, GalNAc-T13 puede influir en la estabilidad y el tráfico de las proteínas, así como en las interacciones con ligandos que repercuten en procesos de señalización y comunicación célula–célula. Se ha informado de una expresión alterada de GALNT13 en múltiples contextos tumorales y se asocia con cambios en comportamientos de células malignas, como la invasión y el potencial metastásico, en consonancia con un papel de la O-glicosilación en la remodelación de la interfaz extracelular. Por lo tanto, este gen es relevante para estudios sobre la biosíntesis de glicoproteínas, la función de la vía secretora y redes de señalización reguladas por glicosilación en células humanas.

El plásmido CRISPR/Cas9 KO GalNAc-T13 (h) es un conjunto de plásmidos diseñado para la interrupción dirigida del gen GALNT13 en líneas celulares human. Cada plásmido coexpresa un ARN guía único (sgRNA) dirigido a un sitio distinto dentro del GALNT13 junto con la nucleasa Cas9 de Streptococcus pyogenes. Los plásmidos también codifican GFP, lo que permite la identificación fluorescente y el enriquecimiento de las células transfectadas con éxito mediante microscopía de fluorescencia o citometría de flujo.

El diseño multiguía aumenta la probabilidad de generar inserciones o deleciones (indeles) que interrumpan el marco de lectura abierto de GALNT13 tras la formación de roturas de doble cadena mediadas por Cas9. Las roturas de ADN introducidas por el sistema CRISPR/Cas9 se reparan a través de vías endógenas de unión de extremos no homólogos (NHEJ), lo que con frecuencia da lugar a mutaciones de desplazamiento del marco de lectura que anulan la expresión de la proteína GalNAc-T13.

Este sistema de knockout CRISPR permite la generación eficiente de modelos celulares deficientes en GALNT13 para la investigación de la señalización de GalNAc-T13, estudios de genómica funcional, investigación en biología del cáncer y evaluación de respuestas terapéuticas en líneas celulares humanas.

Características principales

• sgRNA dirigidos a los exones de GALNT13 críticos para la función de GalNAc-T13
  Coexpresión de SpCas9 y sgRNA a partir de un único plásmido para simplificar la administración
  Reportero GFP para la identificación de células transfectadas
  Conjunto de plásmidos dirigidos a múltiples sitios genómicos de GALNT13 para mejorar la eficiencia del knockout
  Compatible con la administración mediante transfección

Variantes de diseño

CRISPRs +/- HDRs

• Los gRNA codificados por el plásmido GalNAc-T13 CRISPR/Cas9 KO (h) y el plásmido GalNAc-T13 CRISPR/Cas9 KO (h2) se dirigen a sitios distintos dentro del locus GALNT13. Puede estar disponible uno o ambos diseños de orientación. Consulte «Productos relacionados» para conocer la disponibilidad.
  Las construcciones donantes HDR codificadas por el plásmido HDR GalNAc-T13 (h) y el plásmido HDR GalNAc-T13 (h2) contienen un casete de resistencia a la puromicina y un reportero RFP flanqueado por brazos de homología GALNT13 para facilitar la reparación dirigida por homología en sitios diana GALNT13 definidos que se corresponden con los diseños de KO de CRISPR/Cas9. La disponibilidad de los donantes HDR puede variar. Consulte «Productos relacionados» para conocer la disponibilidad.

Sólo para uso en investigación. No destinado a uso diagnóstico o terapéutico.