CTCF Gel Shift Oligonucleotides: sc-2613

Los oligonucleótidos de cambio de gel CTCF son secuencias cortas de ADN sintetizadas de forma compleja para su aplicación en ensayos de cambio de gel, una técnica fundamental en la investigación de biología molecular destinada a escudriñar las interacciones proteína-ADN. El acrónimo "CTCF" corresponde a CCCTC-binding factor, un factor de transcripción muy conservado que interviene en diversos procesos celulares, como la regulación transcripcional, la organización de la cromatina y la impronta genómica. CTCF se une a secuencias específicas de ADN, conocidas como sitios de unión a CTCF o secuencias aislantes, dentro del genoma, donde actúa como un regulador versátil de la expresión génica modulando la estructura de la cromatina y facilitando las interacciones de largo alcance entre regiones genómicas distantes. Mediante la utilización de oligonucleótidos de CTCF en ensayos de cambio de gel, los investigadores pueden explorar la cinética de unión, la especificidad y la afinidad de CTCF a sus secuencias de ADN diana en diversas condiciones experimentales. Esta técnica permite elucidar los mecanismos moleculares que subyacen a la regulación génica mediada por CTCF y proporciona información sobre la compleja organización arquitectónica del genoma.

Referencias:

1. El silenciamiento epigenético en la ataxia de Friedreich está asociado a la depleción de CTCF (CCCTC-binding factor) y a la transcripción antisentido.  |  De Biase, I., et al. 2009. PLoS One. 4: e7914. PMID: 19956589
2. Identificación y Caracterización Funcional de los Elementos Cis-Reguladores que Controlan la Expresión del Gen ADRB2 Porcino.  |  Jaeger, A., et al. 2015. Int J Biol Sci. 11: 1006-15. PMID: 26221068