COL15A1 Plásmido CRISPR/Cas9 KO (h): sc-404027

Descripción general

COL15A1 codifica la cadena alfa 1 del colágeno tipo XV, un colágeno no fibrilar localizado en la membrana basal y en la matriz extracelular pericelular, donde contribuye a sostener la arquitectura tisular y la comunicación célula–matriz. Al participar en el ensamblaje y la remodelación de la matriz extracelular, COL15A1 influye en programas de adhesión, migración y mecanotransducción que convergen con la señalización de integrinas/FAK y con la disponibilidad de factores de crecimiento regulada por la matriz. La alteración de la expresión de COL15A1 se asocia con cambios en la organización del estroma, en el comportamiento del nicho angiogénico y en fenotipos invasivos observados en múltiples contextos patológicos, incluida la biología del cáncer y las patologías asociadas al sistema vascular. Como componente de la matriz extracelular, COL15A1 se estudia con frecuencia por su papel en la regulación del microambiente que modula el comportamiento de células epiteliales y endoteliales.

El plásmido CRISPR/Cas9 KO COL15A1 (h) es un conjunto de plásmidos diseñado para la interrupción dirigida del gen COL15A1 en líneas celulares human. Cada plásmido coexpresa un ARN guía único (sgRNA) dirigido a un sitio distinto dentro del COL15A1 junto con la nucleasa Cas9 de Streptococcus pyogenes. Los plásmidos también codifican GFP, lo que permite la identificación fluorescente y el enriquecimiento de las células transfectadas con éxito mediante microscopía de fluorescencia o citometría de flujo.

El diseño multiguía aumenta la probabilidad de generar inserciones o deleciones (indeles) que interrumpan el marco de lectura abierto de COL15A1 tras la formación de roturas de doble cadena mediadas por Cas9. Las roturas de ADN introducidas por el sistema CRISPR/Cas9 se reparan a través de vías endógenas de unión de extremos no homólogos (NHEJ), lo que con frecuencia da lugar a mutaciones de desplazamiento del marco de lectura que anulan la expresión de la proteína COL15A1.

Este sistema de knockout CRISPR permite la generación eficiente de modelos celulares deficientes en COL15A1 para la investigación de la señalización de COL15A1, estudios de genómica funcional, investigación en biología del cáncer y evaluación de respuestas terapéuticas en líneas celulares humanas.

Características principales

• sgRNA dirigidos a los exones de COL15A1 críticos para la función de COL15A1
  Coexpresión de SpCas9 y sgRNA a partir de un único plásmido para simplificar la administración
  Reportero GFP para la identificación de células transfectadas
  Conjunto de plásmidos dirigidos a múltiples sitios genómicos de COL15A1 para mejorar la eficiencia del knockout
  Compatible con la administración mediante transfección

Variantes de diseño

CRISPRs +/- HDRs

• Los gRNA codificados por el plásmido COL15A1 CRISPR/Cas9 KO (h) y el plásmido COL15A1 CRISPR/Cas9 KO (h2) se dirigen a sitios distintos dentro del locus COL15A1. Puede estar disponible uno o ambos diseños de orientación. Consulte «Productos relacionados» para conocer la disponibilidad.
  Las construcciones donantes HDR codificadas por el plásmido HDR COL15A1 (h) y el plásmido HDR COL15A1 (h2) contienen un casete de resistencia a la puromicina y un reportero RFP flanqueado por brazos de homología COL15A1 para facilitar la reparación dirigida por homología en sitios diana COL15A1 definidos que se corresponden con los diseños de KO de CRISPR/Cas9. La disponibilidad de los donantes HDR puede variar. Consulte «Productos relacionados» para conocer la disponibilidad.

Sólo para uso en investigación. No destinado a uso diagnóstico o terapéutico.