Date published: 2026-8-27

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ATF-5 Double Nickase Plasmid (h): sc-416821-NIC

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Datenblätter
  • Zielspezies: human
  • 20 µg transfektionsfertige, aufgereinigte Plasmid DNA; geeignet für 20 Transfektionen
  • Das ATF-5 Double Nickase Plasmid (h) wird als Plasmid-Paar geliefert. Die einzelnen Plasmide kodieren für eine D10A mutierte Cas9 Nuklease sowie für je eine unterschiedliche, zielspezifische 20nt guide RNA (gRNA) Sequenz. Dies erlaubt eine hohe Knockout-Effizienz bei gleichzeitig größerer Spezifität als das entsprechende CRISPR/Cas9 KO Plasmid
  • gRNA Sequenzpaare liegen ca. 20 bp auseinander um ein spezifisches Cas9-vermitteltes "Double Nicking" der genomischen DNA zu erlauben und so im Resultat den Effekt eines Doppelstrangbruchs nachzuahmen.
  • Ein Plasmid kodiert für ein Puromycin-Resistenzgen zur Selektion von stabilen Knockout-Zellen. Das andere Plasmid kodiert für ein GFP-Gen für den visuellen Nachweis der Transfektion
  • ATF-5 Double-Nickase-Plasmid (h) und ATF-5 Double-Nickase-Plasmid (h2) kodieren unterschiedliche gepaarte gRNA-Designs, die auf ATF5 abzielen. Möglicherweise ist eines oder sind beide Designs verfügbar
  • Nach der Transfektion kann die Effizienz des Gen-Knockouts per Western Blot oder histologisch mit folgendem Antikörper überprüft werden: ATF-5: sc-377168
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    ATF-5 Double Nickase Plasmid (h)

    sc-416821-NIC
    20 µg
    $410.00

    ATF5 kodiert den aktivierenden Transkriptionsfaktor 5 (ATF-5), einen bZIP-Transkriptionsfaktor (basic leucine zipper), der Genexpressionsprogramme koordiniert, die mit zellulärer Stressanpassung, Überleben und der Aufrechterhaltung von Zelllinien/-schicksalen verbunden sind. Die ATF-5-Aktivität ist häufig in Signalwege der Unfolded-Protein-Response und der integrierten Stressantwort eingebunden, einschließlich der PERK–eIF2α–ATF4-Achse-abhängigen transkriptionellen Regulation, und kann die mitochondriale Homöostase sowie apoptosebezogene transkriptionelle Netzwerke beeinflussen. In vielen Zellsystemen unterstützt ATF-5 Proliferation und Resistenz gegenüber metabolischem oder proteotoxischem Stress, was es für Studien zu onkogenem Signaling, Differenzierungszuständen und stressgetriebenem transkriptionellem Remodeling relevant macht. Eine dysregulierte ATF5-Expression wurde in mehreren Tumorkontexten und neurobiologischen Modellen beschrieben, was die Untersuchung seiner nachgeschalteten Zielgene und Signalwegabhängigkeiten in krankheitsassoziierten Phänotypen nahelegt.

    ATF-5 Das Double-Nickase-Plasmid (h) besteht aus einem aufeinander abgestimmten Plasmidpaar, das für die hochspezifische Bearbeitung des ATF5-Lokus in human-Zelllinien entwickelt wurde. Jedes Plasmid exprimiert eine Cas9-D10A-Nickase und eine spezifische sgRNA, die auf entgegengesetzte DNA-Stränge innerhalb von ATF5 abzielt. Wenn sie auf benachbarte Stellen auf entgegengesetzten DNA-Strängen gerichtet sind, erzeugen die beiden Nickasen versetzte Einzelstrang-Schnitte, die zusammen einen versetzten Doppelstrangbruch erzeugen, was eine koordinierte On-Target-Aktivität beider Guides erfordert. Der resultierende DNA-Bruch wird durch endogene zelluläre Reparaturwege behoben, meist durch nicht-homologe Endverknüpfung (NHEJ), was zu Insertionen oder Deletionen führt, die die ATF5-Funktion stören. Durch die Notwendigkeit einer doppelten sgRNA-Bindung am Zielort erhöht der Doppel-Nick-Ansatz die Spezifität der Bearbeitung und bietet eine komplementäre CRISPR-Strategie für Anwendungen, bei denen eine zusätzliche Kontrolle über die Zielgenauigkeit gewünscht ist.

    Um eine effiziente Identifizierung editierter Zellen zu unterstützen, kodiert ein Plasmid GFP zur fluoreszierenden Visualisierung transfizierter Populationen, während das Begleitplasmid ein Puromycin-Resistenzgen für die Antibiotika-Selektion trägt. Zusammen unterstützen diese Merkmale eine effiziente Anreicherung co-transfizierter Populationen und vereinfachen die Validierung von Klonen mit ATF5-Störung.

    Nur für Forschungszwecke. Nicht für diagnostische oder therapeutische Zwecke bestimmt.