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ARF6 CRISPR Activation Plasmid (h) | sc-400799-ACT | 20 µg | $397.00 |
ARF6 kodiert eine kleine Ras-verwandte GTPase, die das Remodeling der Plasmamembran, die clathrinunabhängige Endozytose sowie das Recycling von Membranproteinen durch eine koordinierte Kontrolle des Phosphoinositidstoffwechsels und der Aktindynamik reguliert. Der Wechsel zwischen GDP- und GTP-gebundenen Zuständen positioniert ARF6 als übergeordneten Regulator von Signalwegen, die Zellpolarität, den Turnover von Adhärenzverbindungen und den Integrin-Transport steuern und damit Migration und invasives Verhalten beeinflussen. Die ARF6-Signalgebung ist mit RHO-Familien-GTPasen sowie MAPK-/PI3K-assoziierten Programmen verknüpft, die die Organisation des Zytoskeletts und die Verfügbarkeit von Rezeptoren an der Zelloberfläche feinabstimmen. Eine Fehlregulation der ARF6-Aktivität wurde in Krebsmodellen mit veränderter Motilität und metastaseassoziierten Phänotypen in Verbindung gebracht sowie mit Defekten der neuronalen Morphogenese und des synaptischen Membrantransports, die für die Neurobiologie relevant sind.
ARF6 Das CRISPR-Aktivierungsplasmid (h) bietet einen gezielten, nicht-destruktiven Ansatz zur Hochregulierung der endogenen ARF6-Expression, ohne die zugrunde liegende DNA-Sequenz zu verändern.
ARF6 Das CRISPR-Aktivierungsplasmid (h) ist ein aus drei Plasmiden bestehendes synergistisches Aktivierungsmediator-System (SAM), das für eine hocheffiziente, ortsspezifische transkriptionelle Hochregulation des ARF6-Lokus in menschlichen Zelllinien entwickelt wurde. Das System basiert auf einem katalytisch inaktiven Cas9 (dCas9), das zwei inaktivierende Mutationen (D10A und N863A) trägt, welche die Nukleaseaktivität eliminieren, während die DNA-Bindung erhalten bleibt. Dieses dCas9 ist mit VP64, einem potenten Transkriptionsaktivator, fusioniert und wird zusammen mit einem Blasticidin-Resistenzgen zur Selektion koexprimiert. Das zweite Plasmid kodiert das MS2-p65-HSF1-Fusionsprotein, einen sekundären Aktivatorkomplex, der zusammen mit dCas9-VP64 wirkt, sowie ein Hygromycin-Resistenzgen. Das dritte Plasmid kodiert für eine zielspezifische 20-nt-sgRNA, die an zwei MS2-RNA-Aptamere fusioniert ist, welche den MS2-p65-HSF1-Komplex an die Aktivierungsstelle rekrutieren, begleitet von einem Puromycin-Resistenzgen. Die drei Plasmide werden im Massenverhältnis 1:1:1 verabreicht, um eine ausgewogene Expression aller Systemkomponenten zu gewährleisten.
Nach der Assemblierung am Zielort bindet der SAM-Komplex etwa 200 bp stromaufwärts der ARF6-Transkriptionsstartstelle, wo VP64, p65 und HSF1 gemeinsam die Transkriptionsmaschinerie rekrutieren und die Hochregulation der endogenen ARF6-Expression vorantreiben. Im Gegensatz zu nukleaseaktivem Cas9 verursacht dCas9 keine Doppelstrangbrüche und verändert die genomische Sequenz nicht, wodurch der native ARF6-Locus erhalten bleibt und die Untersuchung von ARF6-abhängigen Transkriptionsreaktionen am endogenen Locus ermöglicht wird. Dies macht es zu einem wertvollen Werkzeug für Funktionsstudien, die Identifizierung von Zielgenen und die Modellierung der Wiederherstellung des ARF6-Signalwegs in Tumorzellen mit stillgelegtem oder reduziertem ARF6-Ausdruck.
Nur für Forschungszwecke. Nicht für diagnostische oder therapeutische Zwecke bestimmt.