apoC-I CRISPR/Cas9 KO Plasmid (m): sc-419163

Übersicht

Apoc1 kodiert Apolipoprotein C‑I (apoC‑I), ein kleines sezerniertes Apolipoprotein, das mit HDL- und VLDL-Partikeln assoziiert ist und den Lipidtransport sowie das Remodeling von Lipoproteinen moduliert. Bei Mäusen beeinflusst apoC‑I das Gleichgewicht zwischen dem Abbau triglyzeridreicher Lipoproteine und dem Cholesterintransport, indem es Rezeptorinteraktionen und die lipaseabhängige Verarbeitung im zirkulierenden Lipoproteinweg beeinflusst. Die Apoc1-Expression ist in Zellen der Makrophagenlinie angereichert und kann Programme der angeborenen Immunantwort mitprägen, die mit der Lipidverarbeitung verknüpft sind. Eine dysregulierte APOC1-Biologie wurde mit atherosklerose-relevanter Entzündung, metabolischer Dyslipidämie und neuroinflammatorischen Kontexten in Verbindung gebracht, was ihren Einsatz in mechanistischen Studien des Immunmetabolismus unterstützt.

Das apoC-I CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (m) ist ein Pool von Plasmiden, die für die gezielte Disruption des Apoc1-Gens in mouse-Zelllinien entwickelt wurden. Jedes Plasmid koexprimiert eine einzigartige Single-Guide-RNA (sgRNA), die auf eine bestimmte Stelle innerhalb des Apoc1-Gens abzielt, zusammen mit der Streptococcus pyogenes Cas9-Nuklease. Die Plasmide kodieren zudem für GFP, was die fluoreszente Identifizierung und Anreicherung erfolgreich transfizierter Zellen mittels Fluoreszenzmikroskopie oder Durchflusszytometrie ermöglicht.

Das Multi-Guide-Design erhöht die Wahrscheinlichkeit, dass Insertionen oder Deletionen (Indels) entstehen, die den offenen Leserahmen von Apoc1 nach der Cas9-vermittelten Bildung von Doppelstrangbrüchen unterbrechen. Durch das CRISPR/Cas9-System verursachte DNA-Brüche werden über endogene NHEJ-Wege (Non-Homologous End Joining) repariert, was häufig zu Frameshift-Mutationen führt, die die apoC-I-Proteinexpression aufheben.

Dieses CRISPR-Knockout-System ermöglicht die effiziente Erzeugung von Apoc1-defizienten Zellmodellen zur Untersuchung der apoC-I-Signalübertragung, für funktionelle Genomstudien, in der Krebsbiologieforschung sowie zur Bewertung therapeutischer Reaktionen in menschlichen Zelllinien.

Hauptmerkmale

• sgRNAs, die auf Apoc1-Exone abzielen, die für die apoC-I-Funktion entscheidend sind
  Ko-Expression von SpCas9 und sgRNA aus einem einzigen Plasmid zur vereinfachten Verabreichung
  GFP-Reporter zur Identifizierung transfizierter Zellen
  Pool von Plasmiden, die auf mehrere Apoc1-Genomstellen abzielen, um die Knockout-Effizienz zu verbessern
  Kompatibel mit der Verabreichung durch Transfektion

Designvarianten

CRISPRs +/- HDRs

• gRNAs, die vom apoC-I CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (m) und vom apoC-I CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (m2) kodiert werden, zielen auf unterschiedliche Stellen innerhalb des Apoc1-Lokus ab. Es kann ein oder beide Targeting-Designs verfügbar sein. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.
  HDR-Donorkonstrukte, kodiert durch das apoC-I HDR-Plasmid (m) und apoC-I HDR-Plasmid (m2) kodiert, enthalten eine Puromycin-Resistenzkassette und einen RFP-Reporter, flankiert von Apoc1-Homologiearmen, um die homologe Reparatur an definierten Apoc1-Zielstellen entsprechend den CRISPR/Cas9-KO-Designs zu unterstützen. Die Verfügbarkeit von HDR-Donoren kann variieren. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.

Nur für Forschungszwecke. Nicht für diagnostische oder therapeutische Zwecke bestimmt.