Los inhibidores químicos de Sec15B interrumpen varias etapas del tráfico vesicular y la dinámica del citoesqueleto, impidiendo así el papel de la proteína en el acoplamiento y la fusión de vesículas en la membrana plasmática. La brefeldina A dificulta el transporte vesicular al inhibir la interacción ARF1/COPI, que es un proceso fundamental para el movimiento de vesículas desde el RE al aparato de Golgi. Del mismo modo, Exo1 y Golgicida A actúan sobre GBF1, un factor de intercambio de nucleótidos de guanina (GEF) para ARF1, necesario para la formación de vesículas desde el RE. Esta inhibición conduce a una reducción del tráfico de vesículas, reduciendo indirectamente la función de Sec15B en la exocitosis. Dynasore y MiTMAB se dirigen a la actividad GTPasa de la dinamina, que es crítica para la liberación de vesículas recubiertas de clatrina. Al impedir la escisión de vesículas, estos inhibidores disminuyen en última instancia el número de vesículas disponibles para que Sec15B actúe sobre ellas, reduciendo así su función en la orientación y fusión de vesículas.
Compuestos como el Nocodazol y la Citocalasina D, que desintegran los microtúbulos y los filamentos de actina, respectivamente, alteran aún más la función de Sec15B. Dicha desintegración es perjudicial para la entrega y el movimiento de vesículas dentro de la célula, etapas cruciales en las que Sec15B ejerce su efecto. La latrunculina B y la jasplakinolida afectan a la dinámica de la actina de forma diferente; la latrunculina B se une a los monómeros de actina e impide su polimerización, mientras que la jasplakinolida estabiliza los filamentos, impidiendo su correcta dinámica. Ambas acciones dan lugar a un deterioro de los procesos de acoplamiento y fusión de vesículas en los que interviene Sec15B. La inhibición de Cdc42 por ML141 también altera la organización de los filamentos de actina, afectando al movimiento de las vesículas hacia la membrana plasmática. SecinH3 ataca a las citohesinas, lo que compromete la actividad de la GTPasa ARF, esencial en la mediación del transporte vesicular y, por extensión, en el papel de Sec15B. Por último, SMIFH2 inhibe la nucleación de actina mediada por formina, alterando aún más la formación de filamentos de actina que es necesaria para la correcta localización y función de Sec15B en la célula.
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