La forskolina y el IBMX actúan elevando los niveles de AMPc, lo que puede activar la PKA e influir en el estado de fosforilación de numerosas proteínas, alterando potencialmente las interacciones proteína-proteína o las modificaciones postraduccionales de REXO4. Del mismo modo, factores de crecimiento como el EGF pueden iniciar la transducción de señales a través del EGFR, activando vías descendentes como MAPK y PI3K, que podrían modificar la actividad o expresión de proteínas que se asocian con REXO4.
Los ésteres de forbol como el PMA, que imitan el diacilglicerol, pueden activar la PKC y alterar posteriormente el estado de fosforilación de las proteínas que podrían interactuar con REXO4. Los inhibidores de moléculas pequeñas como SB203580, LY294002, SP600125 y U0126, dirigidos contra MAPK, PI3K, JNK y MEK1/2 respectivamente, demuestran la interconexión de las vías de señalización intracelular con las actividades de procesamiento del ARN, ya que pueden afectar a la regulación de la actividad de REXO4. La rapamicina, conocida por su papel en la inhibición de mTOR, también afecta a la síntesis de proteínas y al procesamiento del ARN, influyendo potencialmente en la función de REXO4 en estos procesos. Los modificadores epigenéticos como la 5-azacitidina y la tricostatina A, así como los inhibidores de las HDAC como el butirato sódico, pueden provocar cambios en la expresión génica y la dinámica de la cromatina que pueden alterar los niveles de expresión o el estado funcional de las proteínas que regulan o interactúan con REXO4.
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