Los inhibidores de la PQBP-1 representan una clase de moléculas que interactúan específicamente con la proteína de unión a poliglutamina 1 (PQBP-1), una proteína nuclear que desempeña un papel crucial en la regulación transcripcional, el empalme del ARN y la remodelación de la cromatina. Se sabe que la PQBP-1 se une a tractos de poliglutamina, que son secuencias de residuos de glutamina en proteínas, típicamente expandidas en ciertas proteínas asociadas a afecciones neurodegenerativas. La interacción molecular entre la PQBP-1 y sus ligandos es esencial para comprender las redes reguladoras del núcleo, en particular las relacionadas con la organización dinámica de la cromatina y el consiguiente control de la expresión génica. Los inhibidores de la PQBP-1 están diseñados para interrumpir estas interacciones proteína-proteína específicas, alterando así los efectos posteriores sobre la regulación génica y el procesamiento del ARN.
La diversidad estructural de los inhibidores de la PQBP-1 se deriva de la necesidad de unirse selectivamente al dominio de unión a poliglutamina de la PQBP-1 sin afectar a otros dominios o proteínas dentro de la célula. Estos inhibidores suelen presentar arquitecturas moleculares complejas, diseñadas para lograr una elevada especificidad y afinidad por la PQBP-1. Los estudios estructurales han demostrado que estos inhibidores pueden imitar los ligandos naturales de PQBP-1 o, alternativamente, ocupar el sitio de unión de una manera que impide la asociación de PQBP-1 con sus sustratos naturales. El diseño de inhibidores de PQBP-1 también tiene en cuenta la estabilidad del complejo inhibidor-proteína, el potencial de modulación alostérica y las implicaciones para la localización nuclear. Al modular la actividad de PQBP-1, estos inhibidores proporcionan valiosos conocimientos sobre la función de la proteína y su papel más amplio en la maquinaria celular, incluyendo su implicación en la regulación transcripcional y la modulación de la estructura de la cromatina.
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