Los activadores de PNMA6A funcionan a través de diversas vías de señalización que convergen en la modulación de la actividad de esta proteína. Los agentes que aumentan los niveles intracelulares de AMPc lo hacen estimulando directamente la adenilil ciclasa o a través de vías de receptores acoplados a proteínas G. Este aumento del AMPc puede activar la proteína cinasa A (PKA) y otras proteínas AMPc. Este aumento del AMPc puede activar la proteína quinasa A (PKA) y otros elementos sensibles al AMPc, lo que conduce a la fosforilación y posterior activación de PNMA6A, suponiendo que PNMA6A sea sensible a tales modificaciones postraduccionales. Del mismo modo, los compuestos que impiden la degradación del AMPc y el GMPc pueden potenciar la actividad de PNMA6A al mantener niveles elevados de estos segundos mensajeros dentro de la célula, prolongando así su señalización y el estado activo de las vías dependientes del AMPc o el GMPc.
Además, los activadores que imitan el diacilglicerol (DAG) o aumentan directamente las concentraciones de calcio intracelular pueden activar la proteína quinasa C (PKC) y otras proteínas dependientes del calcio, que podrían fosforilar y activar PNMA6A si es un sustrato para estas quinasas. Las señales de estrés también desempeñan un papel en la activación de PNMA6A, ya que ciertos inhibidores de la síntesis proteica pueden iniciar vías de proteína cinasa activadas por el estrés que, a su vez, podrían conducir a la fosforilación y activación de PNMA6A. Además, los compuestos polifenólicos pueden ejercer sus efectos sobre una variedad de vías de señalización celular, que podrían cruzarse con los mecanismos reguladores de PNMA6A, conduciendo a su activación a través de una compleja red de cascadas de señalización intracelular.
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