La OTUD4, una enzima deubiquitinadora, puede ver potenciada su actividad funcional por sustancias químicas que aumentan la concentración celular de proteínas ubiquitinadas. Los inhibidores del proteasoma, como el MG-132, el bortezomib y la lactocistina, impiden la degradación de las proteínas ubiquitinadas, proporcionando así más sustratos para la actividad enzimática de la OTUD4. Las ubistatinas, que inhiben la unión de las proteínas ubiquitinadas al proteasoma, y el Pyr-41, un inhibidor de la enzima E1 activadora de la ubiquitina, también conducen a una acumulación de proteínas ubiquitinadas, potenciando así la función de desubiquitinación del OTUD4. El PR-619, un inhibidor de DUB de amplio espectro, potencia indirectamente la actividad de OTUD4 al aumentar los niveles de proteínas ubiquitinadas.
La actividad deubiquitinadora de OTUD4 puede ser potenciada aún más por sustancias químicas que influyen en la localización intracelular y la estabilidad de las proteínas ubiquitinadas. El NMS-873, un inhibidor alostérico de p97/VCP, conduce a una acumulación de proteínas ubiquitinadas al impedir su extracción de los complejos. Del mismo modo, la cloroquina, un inhibidor de la degradación lisosomal, y la bafilomicina A1, un inhibidor de la V-ATPasa, impiden la degradación de las proteínas ubiquitinadas, potenciando la función de OTUD4. La leptomicina B, un inhibidor de la exportación nuclear, podría potenciar la actividad de OTUD4 al afectar a la localización de las proteínas ubiquitinadas. Por último, MLN4924, un inhibidor de la enzima activadora de NEDD8, conduce a una acumulación de proteínas neddilatadas. Dado que OTUD4 también puede deubiquitinar proteínas neddilatadas, el aumento de la concentración de estas proteínas puede potenciar aún más la actividad enzimática de OTUD4. Además, IU1, un inhibidor específico de la enzima deubiquitinadora USP14, promueve la acumulación de proteínas ubiquitinadas, potenciando así potencialmente la actividad deubiquitadora de OTUD4.
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