El U18666A afecta al tráfico de colesterol, un determinante crucial de la formación de endosomas y cuerpos multivesiculares (MVB), influyendo así en la esfera operativa de MVB12B. El GW4869 interrumpe el metabolismo de la esfingomielina, alterando la composición de la membrana endosomal y creando un escenario en el que la función de MVB12B está preparada para ajustarse en consecuencia. La manumicina A, al inhibir la Ras farnesiltransferasa, y la genisteína, por su acción sobre las tirosina quinasas, afectan al tráfico de proteínas y a las vías de señalización, lo que puede tener ramificaciones en el papel de MVB12B en la clasificación endosomal.
La bafilomicina A1 y la monensina modulan de forma única el equilibrio del pH endosomal, un cambio ambiental que podría hacer más crítica la capacidad funcional de MVB12B. Del mismo modo, al inhibir componentes clave de la endocitosis, como Pitstop 2 y Dynamin Inhibitor I, Dynasore, podría acentuarse la necesidad celular de la participación de MVB12B en los procesos de tráfico. Las sustancias químicas YM201636 y MLN4924, al dirigirse a PIKfyve y a la neddilación de proteínas respectivamente, generan perturbaciones en el metabolismo de los fosfoinosítidos y en los patrones de ubiquitinación, fomentando condiciones que pueden requerir una mayor actividad de MVB12B. La cloroquina, comúnmente conocida por sus efectos sobre la función autofágica de los lisosomas, presenta un escenario en el que los mecanismos compensatorios que implican a MVB12B podrían activarse para asegurar la correcta clasificación de la carga en MVBs. La unión de Filipina III al colesterol puede considerarse como un perturbador de la integridad de la balsa lipídica, que probablemente tenga efectos posteriores sobre los mecanismos de clasificación endosomal, lo que podría poner de relieve el papel funcional de MVB12B en estos procesos.
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