Los inhibidores de la cinasa LOC729417 como Wortmannin, SB203580, PD0325901, LY294002 y SP600125 funcionan uniéndose a los sitios activos de sus cinasas diana. Esta acción previene los eventos de fosforilación que son esenciales para la activación de las proteínas corriente abajo, que pueden incluir LOC729417 si es parte de o regulado por las vías de señalización de la quinasa. Los inhibidores de la histona desacetilasa, ejemplificados por la tricostatina A, alteran la expresión génica al afectar a la estructura de la cromatina, lo que podría provocar cambios en la síntesis de LOC729417.
La rapamicina, un inhibidor de mTOR, actúa uniéndose específicamente al complejo mTOR, lo que conduce a una reducción de la síntesis proteica de algunas proteínas. En cambio, el 17-AAG actúa desestabilizando varias proteínas cliente que dependen de la chaperona Hsp90, lo que puede afectar al plegamiento y función de multitud de proteínas, entre las que potencialmente se encuentra la LOC729417. Otros inhibidores, como Y-27632, un inhibidor de ROCK, y Thapsigargin, un inhibidor de la bomba SERCA, pueden afectar a la dinámica del citoesqueleto y a los niveles de calcio intracelular, respectivamente. Estos amplios impactos celulares pueden influir indirectamente en las proteínas asociadas a estos sistemas. MG132 inhibe la degradación proteasomal, lo que podría estabilizar LOC729417 impidiendo su descomposición. Por último, ZM-447439 se dirige a las quinasas Aurora, que son esenciales para la progresión del ciclo celular. Al inhibir estas quinasas, el inhibidor puede afectar a proteínas implicadas en la división celular, posiblemente incluyendo LOC729417 si está vinculado al ciclo celular.
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