Wortmannin y ZM-447439, por ejemplo, pueden interrumpir las vías de señalización relacionadas con la supervivencia, el crecimiento y la división celular mediante la inhibición de las quinasas PI3K y Aurora, respectivamente. Esta alteración puede afectar en cascada a la función y regulación de las proteínas implicadas en estos procesos celulares críticos. Del mismo modo, la acción del SB431542 sobre el receptor TGF-beta puede modular las respuestas celulares en términos de proliferación y diferenciación, afectando a las proteínas que responden a estas señales.
KN-93 y PD0325901 permiten comprender la modulación de la señalización al afectar a procesos dependientes del calcio y a la vía MAPK/ERK, respectivamente. El primero puede influir en proteínas reguladas por la señalización del calcio, mientras que el segundo tiene implicaciones para proteínas implicadas en procesos de división y diferenciación celular. Compuestos como la leflunomida y el Go6976 pueden provocar alteraciones en la síntesis del ADN y en la regulación del ciclo celular y la apoptosis, respectivamente, al inhibir la dihidroorotato deshidrogenasa y la proteína cinasa C. Por otro lado, el 2-metoxiestradiol y el 17-AAG se dirigen a los componentes estructurales de la célula y a la estabilidad de las proteínas, influyendo en la mitosis celular, la angiogénesis y la estabilidad de diversas proteínas clientes. Laapsigargina y el clorhidrato de LY-333,531 pueden perturbar los niveles de calcio intracelular y las vías específicas de transducción de señales, lo que puede tener amplias implicaciones para las proteínas reguladas por estas señales. Por último, la inhibición por NS-398 de la ciclooxigenasa-2 puede afectar a proteínas implicadas en la producción de mediadores inflamatorios.
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