La inhibición de mTOR por la rapamicina puede alterar las tasas de síntesis de proteínas, lo que puede afectar a las proteínas que dependen de este proceso para su expresión o función. Los inhibidores de la histona desacetilasa, como la tricostatina A, provocan cambios en la estructura de la cromatina y la expresión génica, lo que a su vez puede influir en la producción y función de numerosas proteínas, incluida la LOC646823. Ibrutinib y ABT-199 interrumpen la señalización dentro de las células B y las vías apoptóticas, respectivamente, lo que puede tener amplios efectos sobre las funciones de las proteínas asociadas a estos procesos.
Los inhibidores de la tirosina cinasa, como el erlotinib y el sorafenib, tienen efectos de amplio alcance debido a las funciones de su diana en la proliferación, diferenciación y angiogénesis celulares. La inhibición del NF-κB por la curcumina afecta a la transcripción de diversos genes, lo que puede tener efectos secundarios en las proteínas reguladas por este factor. La ciclopamina, al actuar sobre la vía Hedgehog, afecta a procesos fundamentales para la diferenciación y proliferación celular. La estaurosporina, como inhibidor de quinasas de amplio espectro, puede tener efectos extensos y de gran alcance sobre las vías de señalización celular, alterando potencialmente la función de multitud de proteínas. Por último, la inhibición de la 5-lipoxigenasa por Zileuton afecta a la síntesis de leucotrienos, que son importantes en la respuesta inflamatoria y pueden afectar indirectamente a funciones proteicas relacionadas con esta vía.
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