Los inhibidores químicos de la proteína LIN-39 actúan a través de diversos mecanismos para modular su función. Palbociclib, un inhibidor de CDK4/6, puede impedir la progresión del ciclo celular, que es crucial para la función adecuada de LIN-39 en la división celular. Del mismo modo, al inhibir el receptor TGF-β, el SB-431542 puede reducir las vías de señalización que influyen en la expresión y la actividad de LIN-39. La vía de señalización PI3K/Akt, que puede ser interrumpida por el LY294002, suele estar aguas arriba de varios genes del desarrollo, incluido el LIN-39, y su inhibición puede reducir las señales necesarias para el papel del LIN-39 en el desarrollo. El U0126 actúa inhibiendo MEK1/2, disminuyendo la regulación de la expresión y actividad de LIN-39 por la vía MAPK/ERK. XAV-939 y LGK-974 se dirigen a la vía de señalización Wnt: XAV-939 estabiliza la axina, lo que conduce a la degradación de la β-catenina, y LGK-974 inhibe la secreción y la actividad de las proteínas Wnt, lo que puede limitar la actividad de LIN-39 en los procesos de desarrollo.
Además, PF-562271, un inhibidor de la quinasa de adhesión focal, puede impedir procesos como la migración y la proliferación celular, en los que la función de LIN-39 es crucial. El DAPT, al inhibir la gamma-secretasa, puede afectar a la señalización Notch que interactúa con la regulación de LIN-39, lo que repercute en su papel en la especificación de linajes. LDN-193189, un inhibidor de BMP, y SP600125, un inhibidor de JNK, pueden alterar el entorno de regulación transcripcional de LIN-39, afectando a su función en el desarrollo de órganos y la diferenciación celular. AZD8055, que inhibe tanto mTORC1 como mTORC2, puede afectar al crecimiento y la proliferación celular, modulando así los contextos de desarrollo en los que actúa LIN-39. Por último, Y-27632, un inhibidor de ROCK, puede modular la dinámica del citoesqueleto y la adhesión celular, procesos en los que interviene LIN-39, afectando así a su papel en el patrón y el desarrollo celulares.
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