Las sustancias químicas enumeradas como activadores indirectos de Isw1p son predominantemente agentes que influyen en la estructura de la cromatina y la expresión génica, lo que refleja el papel de Isw1p en la remodelación de la cromatina. Las histonas desacetilasas como la tricostatina A, el butirato sódico, el ácido valproico y el vorinostat pueden modificar la estructura de la cromatina, potenciando la función de los complejos de remodelación de la cromatina, incluidos los que implican a Isw1p. Estos HDAC aumentan los niveles de acetilación de las histonas, lo que conduce a una estructura de la cromatina más relajada. Tales cambios en la dinámica de la cromatina podrían facilitar el reclutamiento o la función de Isw1p en actividades de remodelación, influyendo en la expresión génica. La 5-Aza-2'-desoxicitidina, un inhibidor de la metiltransferasa del ADN, altera los patrones de metilación del ADN, lo que también puede repercutir en la estructura de la cromatina y, en consecuencia, en la actividad de remodeladores de la cromatina como Isw1p.
La curcumina, el resveratrol y la genisteína son ejemplos de compuestos que modulan las vías de señalización celular y los estados epigenéticos, influyendo en las funciones de Isw1p. Sus efectos sobre la señalización celular y la expresión génica pueden crear un contexto celular que afecte al reclutamiento y la actividad de los complejos de remodelación de la cromatina. La nicotinamida, como sirtuina, y la forskolina, que eleva los niveles de AMPc, demuestran cómo la modulación de la señalización celular clave y los reguladores epigenéticos pueden influir indirectamente en los procesos de remodelación de la cromatina que implican a Isw1p. La rapamicina y el jasmonato de metilo representan compuestos que inciden en procesos y vías celulares más amplios, que pueden afectar indirectamente a la funcionalidad de proteínas remodeladoras de la cromatina como Isw1p, ya sea a través de cambios en la expresión génica o de alteraciones en el entorno celular. En resumen, estos activadores indirectos de Isw1p no actúan directamente sobre la proteína, sino que influyen en una serie de procesos y estructuras celulares, como la dinámica de la cromatina, las vías de señalización y las modificaciones epigenéticas, que son parte integrante de la regulación de la remodelación de la cromatina y, en consecuencia, de las funciones de proteínas como Isw1p.
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