Los inhibidores químicos de la HDA4 se dirigen a la capacidad de la enzima para eliminar los grupos acetilo de las proteínas histonas, un proceso crítico en la regulación de la expresión génica. La tricostatina A, el vorinostat y el panobinostat actúan uniéndose al sitio activo de la HDA4, necesario para su actividad desacetilasa. Esta unión provoca un aumento del nivel de histonas acetiladas, ya que la enzima deja de ser capaz de eliminar eficazmente estos grupos funcionales. La romidepsina actúa a través de un mecanismo similar, pero lo hace como un péptido cíclico que quela el ion zinc dentro del sitio activo de la HDA4, que es vital para la actividad de la enzima. Belinostat y Entinostat también inhiben la HDA4 al unirse a su sitio activo, pero destacan por su selectividad, que permite un enfoque más específico en la inhibición de la función de la enzima.
La chidamida se caracteriza por su estructura benzamídica, que interactúa con el dominio catalítico de la HDA4, inhibiendo así la enzima. Del mismo modo, el ácido valproico, un ácido graso de cadena corta, interrumpe la actividad catalítica de la HDA4, lo que conduce a una acumulación de acetilación en las histonasLos inhibidores químicos de la HDA4 impiden su función desacetilasa, que es esencial para la regulación de la estructura de la cromatina y la expresión génica. La tricostatina A, por ejemplo, inhibe la HDA4 impidiendo la desacetilación de las histonas, lo que conduce a una conformación más abierta de la cromatina. El vorinostat y el panobinostat también son inhibidores de la HDA4, con capacidad para unirse al sitio activo de la enzima, obstruyendo así su función. Estos inhibidores provocan la acumulación de histonas acetiladas, lo que puede afectar a la expresión de los genes regulados por la HDA4. La romidepsina, un péptido cíclico, opera a través de un mecanismo de quelación del ion zinc en el sitio activo de la HDA4, esencial para su actividad desacetilasa, lo que conduce a la inhibición de la función de la enzima.
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