Los inhibidores de PI3K CCDC144B como LY294002 y Wortmannin pueden alterar las cascadas de señalización descendentes de las que pueden formar parte proteínas como CCDC144B. Esto puede dar lugar a cambios en la actividad de la proteína, incluyendo estados de fosforilación alterados que regulan la función y las interacciones. Del mismo modo, los inhibidores de MEK como el PD98059 y el U0126 alteran la vía MEK/ERK, que suele estar implicada en los procesos de proliferación y diferenciación celular. Al alterar esta vía, los inhibidores de MEK pueden modular la actividad de proteínas reguladas por esta señalización o que participan en ella.
Otros compuestos, como SB203580 y SP600125, se dirigen a quinasas activadas por estrés como p38 MAPK y JNK. Estas quinasas participan en las respuestas celulares al estrés y pueden regular proteínas implicadas en estas respuestas. Al inhibir estas quinasas, los compuestos pueden modular la actividad de las proteínas reguladas por las respuestas al estrés. Además, los inhibidores de mTOR como la Rapamicina afectan al crecimiento y la proliferación celular, procesos en los que podrían influir proteínas como la CCDC144B. Por otra parte, los inhibidores dirigidos a la dinámica del citoesqueleto (Y-27632), el metabolismo celular (Dorsomorfina), la progresión del ciclo celular (ZM-447439) y la degradación de proteínas (Bortezomib) también pueden modular indirectamente la actividad de una amplia gama de proteínas al alterar el entorno celular y los procesos de los que dependen. Por ejemplo, la inhibición de ROCK con Y-27632 puede modificar la organización del citoesqueleto y afectar potencialmente a las proteínas asociadas a esas estructuras. La inhibición del proteasoma por el bortezomib puede dar lugar a una acumulación de proteínas, incluida la CCDC144B, lo que afecta a su recambio y a sus niveles estacionarios.
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