El ATP es la moneda universal de energía en la célula y un sustrato para las quinasas, enzimas que catalizan la fosforilación de proteínas, lo que a menudo conduce a su activación. Los antagonistas de la calmodulina, como el W-7, perturban la función de las quinasas dependientes de la calmodulina, alterando potencialmente el estado de activación de numerosas proteínas. El fluoruro de sodio actúa como activador inhibiendo las fosfatasas, impidiendo así la desfosforilación de las proteínas y manteniéndolas en estado activo. El cloruro de zinc contribuye a la activación de las proteínas sirviendo como elemento estructural esencial que estabiliza su conformación funcional, mientras que el cloruro de magnesio es crucial para la actividad de las ATPasas y las quinasas, facilitando la transferencia de grupos fosfato a las proteínas. Se sabe que los PMA activan la proteína cinasa C, que fosforila las proteínas diana, dando lugar a respuestas celulares variadas. El SNAP, a través de la liberación de óxido nítrico, estimula la guanilil ciclasa, aumentando los niveles de GMPc e influyendo en la función de las proteínas.
La ciclosporina A es única en el sentido de que inhibe la calcineurina, una fosfatasa crítica para la desactivación de muchas proteínas, manteniendo así indirectamente las proteínas en su estado activo. El ácido ocadaico sigue un camino similar al inhibir las serina/treonina fosfatasas, lo que provoca un aumento de la fosforilación de las proteínas. El peróxido de hidrógeno, aunque comúnmente visto como un subproducto del estrés oxidativo, también sirve como una molécula de señalización, modulando la actividad de las proteínas a través de la oxidación. La estaurosporina, aunque conocida principalmente como inhibidor de la cinasa, puede, en concentraciones subinhibitorias, activar paradójicamente determinadas cinasas, lo que repercute en la activación de las proteínas. El cloruro de litio se dirige a GSK-3β, una cinasa implicada en numerosas vías de señalización, y su inhibición puede conducir a la modulación de las actividades proteicas dentro de estas vías.
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