La estaurosporina es un potente inhibidor de la cinasa con una amplia gama de dianas, capaz de interrumpir los eventos de fosforilación que son fundamentales para muchas vías de señalización celular. Su actividad de amplio espectro implica que puede influir en la actividad de numerosas proteínas dentro de estas vías. La rapamicina y compuestos similares inhiben la vía de señalización mTOR, crucial para el crecimiento y la proliferación celular. Al inhibir mTOR, estos compuestos pueden alterar la función de proteínas que forman parte de esta vía o están reguladas por ella. La cicloheximida y la actinomicina D son inhibidores clásicos de la síntesis de proteínas y ARN, respectivamente, que afectan a la expresión de muchas proteínas en diversas vías.
El MG132 se dirige al sistema ubiquitina-proteasoma, que desempeña un papel fundamental en la degradación de proteínas. Al inhibir la actividad proteasomal, la MG132 puede provocar la acumulación o estabilización de proteínas dentro de la célula, afectando a su dinámica funcional. La brefeldina A, al afectar al tráfico vesicular, puede alterar la localización y el procesamiento de las proteínas que transitan por el retículo endoplásmico (RE) y el aparato de Golgi. Inhibidores como la 2-Deoxi-D-glucosa interfieren en vías metabólicas como la glucólisis, afectando al metabolismo energético de la célula y, potencialmente, a proteínas asociadas al metabolismo. El PD98059 y el U0126 son inhibidores específicos de la MEK, que forma parte de la cascada de señalización MAPK/ERK, una vía a menudo implicada en la diferenciación y proliferación celulares.
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