Los inhibidores dirigidos a la actividad funcional de C11orf47 incluyen una serie de compuestos que actúan en diversas vías celulares y moleculares. Estos inhibidores se seleccionan basándose en el supuesto de que C11orf47 participa en estas vías o se ve afectado por ellas. LY294002 y Wortmannin, por ejemplo, inhiben la vía PI3K/AKT, una cascada de señalización crítica que regula la supervivencia y la proliferación celular. Si C11orf47 es un sustrato de AKT, la inhibición de PI3K daría lugar a una menor fosforilación y posterior actividad de C11orf47, ya que PI3K se encuentra aguas arriba de AKT.
Del mismo modo, compuestos como PD98059, U0126, SP600125 y SB203580 se dirigen a la cascada de señalización MAPK en diferentes puntos. El PD98059 y el U0126 inhiben la MEK, que se encuentra aguas arriba de la ERK1/2, mientras que el SP600125 y el SB203580 inhiben específicamente la JNK y la p38 MAPK, respectivamente. Si C11orf47 es un efector corriente abajo de una o más de estas MAPKs, su actividad se vería disminuida en presencia de estos inhibidores debido a la reducción de las señales de fosforilación. La inhibición de la señalización mTOR por parte de la rapamicina, que desempeña un papel central en el crecimiento y el metabolismo celular, podría reducir de forma similar la actividad de C11orf47 si forma parte de la red de señalización mTOR.
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