ZNF580 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h): sc-406194

Übersicht

ZNF580 ist ein KRAB-haltiges C2H2-Zinkfingerprotein, das in erster Linie als Transkriptionsregulator wirkt und die sequenzspezifische DNA-Bindung mit chromatinmodifizierenden Komplexen verknüpft, die Genexpressionsprogramme formen. Es wurde mit der Kontrolle des Verhaltens von Endothelzellen in Verbindung gebracht, einschließlich Migration und angiogener Antworten, sowie mit der Koordination von Signalwegen bei oxidativem Stress und Entzündungsreaktionen. Über diese regulatorischen Funktionen kann ZNF580 Signalwege beeinflussen, die Gefäßremodellierung, Zellzyklusprogression und stressresponsive Transkription steuern. Eine fehlregulierte Expression oder Aktivität von ZNF580 wurde mit vaskulären pathologischen Kontexten wie atherosklerosebezogenen Prozessen und ischämiebedingter endothelialer Dysfunktion assoziiert, was es zu einem nützlichen Ansatzpunkt für mechanistische Studien der vaskulären Biologie macht.

Das ZNF580 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h) ist ein Pool von Plasmiden, die für die gezielte Disruption des ZNF580-Gens in human-Zelllinien entwickelt wurden. Jedes Plasmid koexprimiert eine einzigartige Single-Guide-RNA (sgRNA), die auf eine bestimmte Stelle innerhalb des ZNF580-Gens abzielt, zusammen mit der Streptococcus pyogenes Cas9-Nuklease. Die Plasmide kodieren zudem für GFP, was die fluoreszente Identifizierung und Anreicherung erfolgreich transfizierter Zellen mittels Fluoreszenzmikroskopie oder Durchflusszytometrie ermöglicht.

Das Multi-Guide-Design erhöht die Wahrscheinlichkeit, dass Insertionen oder Deletionen (Indels) entstehen, die den offenen Leserahmen von ZNF580 nach der Cas9-vermittelten Bildung von Doppelstrangbrüchen unterbrechen. Durch das CRISPR/Cas9-System verursachte DNA-Brüche werden über endogene NHEJ-Wege (Non-Homologous End Joining) repariert, was häufig zu Frameshift-Mutationen führt, die die ZNF580-Proteinexpression aufheben.

Dieses CRISPR-Knockout-System ermöglicht die effiziente Erzeugung von ZNF580-defizienten Zellmodellen zur Untersuchung der ZNF580-Signalübertragung, für funktionelle Genomstudien, in der Krebsbiologieforschung sowie zur Bewertung therapeutischer Reaktionen in menschlichen Zelllinien.

Hauptmerkmale

• sgRNAs, die auf ZNF580-Exone abzielen, die für die ZNF580-Funktion entscheidend sind
  Ko-Expression von SpCas9 und sgRNA aus einem einzigen Plasmid zur vereinfachten Verabreichung
  GFP-Reporter zur Identifizierung transfizierter Zellen
  Pool von Plasmiden, die auf mehrere ZNF580-Genomstellen abzielen, um die Knockout-Effizienz zu verbessern
  Kompatibel mit der Verabreichung durch Transfektion

Designvarianten

CRISPRs +/- HDRs

• gRNAs, die vom ZNF580 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h) und vom ZNF580 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h2) kodiert werden, zielen auf unterschiedliche Stellen innerhalb des ZNF580-Lokus ab. Es kann ein oder beide Targeting-Designs verfügbar sein. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.
  HDR-Donorkonstrukte, kodiert durch das ZNF580 HDR-Plasmid (h) und ZNF580 HDR-Plasmid (h2) kodiert, enthalten eine Puromycin-Resistenzkassette und einen RFP-Reporter, flankiert von ZNF580-Homologiearmen, um die homologe Reparatur an definierten ZNF580-Zielstellen entsprechend den CRISPR/Cas9-KO-Designs zu unterstützen. Die Verfügbarkeit von HDR-Donoren kann variieren. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.

Nur für Forschungszwecke. Nicht für diagnostische oder therapeutische Zwecke bestimmt.