Xylene Cyanol FF (CAS 2650-17-1)

Xylene Cyanol FF mit der CAS-Nummer 2650-17-1 ist ein synthetischer Farbstoff, der häufig in der molekularbiologischen und biochemischen Forschung verwendet wird, insbesondere bei der Visualisierung von Biomolekülen während elektrophoretischer Techniken. Diese Chemikalie gehört zur Familie der Triarylmethan-Farbstoffe und zeichnet sich durch ihre ausgeprägte blau-grüne Farbe aus. Xylene Cyanol FF dient in erster Linie als Tracking-Farbstoff in Gelelektrophorese-Anwendungen und hilft bei der Einschätzung der Migration von Nukleinsäuren durch Agarose- oder Polyacrylamid-Gele. Er ist unter typischen elektrophoretischen Bedingungen negativ geladen, so dass er in der gleichen Richtung wie DNA- oder RNA-Fragmente zur Anode wandert. In der Praxis läuft Xylene Cyanol FF in der Regel mit der gleichen Geschwindigkeit wie ein DNA-Fragment mit etwa 4.000 Basenpaaren in einem Standard-Agarosegel und etwa 106 Basenpaaren in Polyacrylamidgelen, wodurch es den Forschern als visuelle Referenz dient, um den Fortschritt und die ungefähre Größe der Nukleinsäurefragmente während der Trennung zu beurteilen. Neben seiner Rolle bei der Visualisierung wird seine molekulare Struktur auch in der Forschung genutzt, um die Wechselwirkungen zwischen Farbstoff und Biomolekül zu verstehen, was zur Entwicklung von verbesserten Färbeprotokollen und Analysetechniken in den Biowissenschaften beiträgt. Seine Anwendung erstreckt sich auch auf andere Forschungsbereiche, einschließlich seiner Verwendung als pH-Indikator und als Bestandteil bei der Formulierung verschiedener Farbstandards.