XTP3TPA CRISPR/Cas9 KOプラスミド (h): sc-407430

概要

DCTPP1は、XTP3TPAをコードしている。XTP3TPAは細胞質に局在するdCTPピロホスファターゼで、非正規のデオキシヌクレオシド三リン酸を加水分解し、dNTPプールのバランス維持とヌクレオチドの品質管理に寄与する。異常なヌクレオチドのDNAへの取り込みを抑えることで、XTP3TPAはゲノム安定性、複製の忠実性、ならびにDNA修復と複製ストレス応答の連携を支える。ヌクレオチド代謝の変化とdNTPプールの不均衡は、増殖状態や腫瘍生物学に共通して見られる特徴であり、そのためDCTPP1は、ヌクレオチドのサニタイゼーション（浄化）、酸化損傷、変異誘発の関連を研究するうえで有用な結節点となる。DCTPP1の機能解析は、ヒト細胞における代謝リプログラミングがDNA損傷シグナル伝達および細胞周期制御に結び付く機構の解明に資する。

XTP3TPA CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）は、human細胞株におけるDCTPP1遺伝子の標的破壊を目的として設計されたプラスミドのプールである。各プラスミドは、DCTPP1内の異なる部位を標的とする固有のシングルガイドRNA（sgRNA）と、Streptococcus pyogenes由来のCas9ヌクレアーゼを共発現します。また、これらのプラスミドはGFPをコードしており、蛍光顕微鏡やフローサイトメトリーを用いて、トランスフェクションに成功した細胞を蛍光で識別・濃縮することが可能です。

このマルチガイド設計により、Cas9による二本鎖切断の形成後に、DCTPP1のオープンリーディングフレームを破壊する挿入または欠失（インデル）が生じる可能性が高まります。CRISPR/Cas9システムによって導入されたDNA切断は、内因性の非相同末端結合（NHEJ）経路を通じて修復され、その結果、XTP3TPAタンパク質の発現を阻害するフレームシフト変異が生じることが頻繁にあります。

このCRISPRノックアウトシステムにより、XTP3TPAシグナル伝達、機能ゲノミクス研究、がん生物学研究、およびヒト細胞株における治療反応の評価を目的とした、DCTPP1欠損細胞モデルの効率的な作製が可能となる。

主な特徴

• XTP3TPAの機能に不可欠なDCTPP1エクソンを標的とするsgRNA
  導入を簡素化するための、単一プラスミドからのSpCas9およびsgRNAの共発現
  トランスフェクトされた細胞を識別するためのGFPレポーター
  ノックアウト効率を向上させるための、DCTPP1ゲノム上の複数の部位を標的とするプラスミドのプール
  トランスフェクションによる導入に対応

設計バリエーション

CRISPRs +/- HDR

• XTP3TPA CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）およびXTP3TPA CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h2）によってコードされるgRNAは、DCTPP1遺伝子座内の異なる部位を標的としています。いずれか一方、または両方の標的設計が利用可能な場合があります。入手可能性については「関連製品」を参照してください。
  XTP3TPA HDRプラスミド（h）および XTP3TPA HDRプラスミド（h2）によってコードされるHDRドナー構築体は、プロマイシン耐性カセットとRFPレポーターを含み、これらはDCTPP1ホモロジーアームに挟まれており、CRISPR/Cas9 KO設計に対応する特定のDCTPP1標的部位でのホモロジー依存修復をサポートします。HDRドナーの入手可能性は異なる場合があります。入手可能性については「関連製品」をご確認ください。

研究用のみ。診断用または治療用ではありません。