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V-ATPase B2 CRISPR Activationプラスミド (h) | sc-401896-ACT | 20 µg | $397.00 |
ATP6V1B2は、液胞型H+-ATPase(V-ATPase)のV1周辺ドメインを構成するB2サブユニットをコードします。V-ATPaseは、ATPを加水分解してエンドソームやリソソームなどの細胞内区画を酸性化する、多サブユニットからなるプロトンポンプです。このオルガネラの酸性化は、受容体媒介性エンドサイトーシス、オートファジーフラックス、リソソーム酵素の活性化、ならびに小胞輸送に不可欠であり、さらに栄養感知やmTORに関連した代謝適応にも間接的に影響します。内腔pHを調節することで、V-ATPase活性はタンパク質のプロセシングと分解回転、抗原プロセシング、膜タンパク質のリサイクリングにも作用します。V-ATPase構成要素が関わる小胞およびリソソームの酸性化経路の破綻は、神経発達・神経学的表現型や、より広範な細胞内トラフィッキング異常を伴う疾患と関連づけられており、そのためATP6V1B2はプロテオスタシスおよびエンドリソソーム機能不全を研究するうえで有用な結節点となります。
V-ATPase B2 CRISPR活性化プラスミド(h)は、基盤となるDNA配列を変更することなく、内因性ATP6V1B2の発現を標的化し、非破壊的にアップレギュレートするアプローチを提供します。
V-ATPase B2 CRISPR 活性化プラスミド (h) は、ヒト細胞株における ATP6V1B2 遺伝子座の高効率かつ部位特異的な転写アップレギュレーションのために設計された、3 つのプラスミドからなる相乗的活性化メディエーター (SAM) システムです。このシステムは、DNA結合能を維持しつつヌクレアーゼ活性を失わせる2つの不活性化変異(D10AおよびN863A)を有する、触媒活性のないCas9(dCas9)を中核としています。このdCas9は、強力な転写活性化因子であるVP64と融合しており、選別用のブラスティシジン耐性遺伝子と共に共発現します。2番目のプラスミドは、dCas9-VP64と協調して機能する二次活性化複合体であるMS2-p65-HSF1融合タンパク質をコードしており、ヒグロマイシン耐性遺伝子と共に発現する。3番目のプラスミドは、標的特異的な20塩基対のsgRNAをコードしており、これはMS2-p65-HSF1複合体を活性化部位に誘導する2つのMS2 RNAアプタマーと融合しており、さらにピューロマイシン耐性遺伝子が付随している。これら3つのプラスミドは、システム構成要素すべてが均等に発現するよう、質量比1:1:1で導入される。
標的遺伝子座に集合すると、SAM複合体はATP6V1B2転写開始点の上流約200 bpの領域に結合し、そこでVP64、p65、およびHSF1が協調して転写装置を動員し、内因性V-ATPase B2の発現上昇を促進する。ヌクレアーゼ活性を持つCas9とは異なり、 dCas9は二本鎖切断を導入したりゲノム配列を改変したりしないため、天然のATP6V1B2遺伝子座が保持され、内因性遺伝子座におけるV-ATPase B2依存性の転写応答の研究が可能となります。これにより、機能解析、標的遺伝子の同定、およびATP6V1B2発現が沈黙または低下した腫瘍細胞におけるV-ATPase B2経路の回復のモデル化を行う上で、貴重なツールとなります。
研究用のみ。診断用または治療用ではありません。