USP39 Plasmide KO CRISPR/Cas9 (h): sc-406847

Panoramica

USP39 (nota anche come omologo di SAD1) codifica un fattore associato allo spliceosoma essenziale per lo splicing del pre‑mRNA, pur essendo priva di attività catalitica di deubiquitinasi. Contribuisce all’assemblaggio e alla funzione del tri‑snRNP U4/U6·U5 e favorisce la corretta rimozione degli introni, collegando USP39 alla regolazione globale del trascrittoma e alla progressione del ciclo cellulare. L’alterazione di USP39 compromette programmi di processamento dell’RNA che influenzano proliferazione, mantenimento del genoma e risposte allo stress, processi spesso modificati nel cancro e in altri disturbi proliferativi. Di conseguenza, USP39 è ampiamente studiata per il suo ruolo nel controllo, dipendente dallo splicing, dell’espressione genica e delle vie che governano la fedeltà mitotica.

Il plasmide CRISPR/Cas9 KO USP39 (h) è un pool di plasmidi progettato per la distruzione mirata del gene USP39 in linee cellulari human. Ciascun plasmide co-esprime un singolo RNA guida (sgRNA) unico che prende di mira un sito distinto all'interno del USP39 insieme alla nucleasi Cas9 di Streptococcus pyogenes. I plasmidi codificano anche per la GFP, consentendo l'identificazione fluorescente e l'arricchimento delle cellule trasfettate con successo tramite microscopia a fluorescenza o citometria a flusso.

Il design multi-guida aumenta la probabilità di generare inserzioni o delezioni (indels) che interrompono il frame di lettura aperto USP39 a seguito della formazione di rotture a doppio filamento mediate da Cas9. Le rotture del DNA introdotte dal sistema CRISPR/Cas9 vengono riparate attraverso vie endogene di giunzione non omologa (NHEJ), che spesso provocano mutazioni con spostamento del frame che annullano l'espressione della proteina USP39.

Questo sistema di knockout CRISPR consente la generazione efficiente di modelli cellulari carenti di USP39 per lo studio della segnalazione di USP39, studi di genomica funzionale, ricerca sulla biologia del cancro e valutazione delle risposte terapeutiche in linee cellulari umane.

Caratteristiche principali

• sgRNA mirati agli esoni USP39 critici per la funzione di USP39
  Co-espressione di SpCas9 e sgRNA da un singolo plasmide per una somministrazione semplificata
  Reporter GFP per l'identificazione delle cellule trasfettate
  Pool di plasmidi mirati a più siti genomici di USP39 per migliorare l'efficienza del knockout
  Compatibile con la somministrazione tramite trasfezione

Varianti di progettazione

CRISPR +/- HDR

• Gli gRNA codificati dal USP39 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h) e dal USP39 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h2) prendono di mira siti distinti all'interno del locus USP39. Potrebbe essere disponibile uno o entrambi i design di targeting. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.
  I costrutti donatori HDR codificati dal USP39 Plasmide HDR (h) e il plasmide HDR USP39 (h2) contengono una cassetta di resistenza alla puromicina e un reporter RFP affiancato da bracci di omologia USP39 per supportare la riparazione diretta dall'omologia in siti bersaglio USP39 definiti corrispondenti ai disegni CRISPR/Cas9 KO. La disponibilità dei donatori HDR può variare. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.

Solo per uso di ricerca. Non destinato a uso diagnostico o terapeutico.