USP39 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h): sc-406847

Übersicht

USP39 (auch als SAD1-Homolog bekannt) kodiert einen spleißosomenassoziierten Faktor, der trotz fehlender deubiquitinase-katalytischer Aktivität für das Spleißen von prä-mRNA essenziell ist. Es trägt zur Assemblierung und Funktion des U4/U6·U5-Tri-snRNP bei und unterstützt die korrekte Entfernung von Introns, wodurch USP39 mit der globalen Regulation des Transkriptoms und dem Fortschreiten des Zellzyklus verknüpft ist. Eine Störung von USP39 beeinträchtigt RNA-Verarbeitungsprogramme, die Proliferation, Genom-Erhalt und Stressantworten beeinflussen – Prozesse, die bei Krebs und anderen proliferativen Erkrankungen häufig verändert sind. Daher wird USP39 intensiv hinsichtlich seiner Rolle in der spleißabhängigen Kontrolle der Genexpression und in Signalwegen untersucht, die die mitotische Genauigkeit steuern.

Das USP39 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h) ist ein Pool von Plasmiden, die für die gezielte Disruption des USP39-Gens in human-Zelllinien entwickelt wurden. Jedes Plasmid koexprimiert eine einzigartige Single-Guide-RNA (sgRNA), die auf eine bestimmte Stelle innerhalb des USP39-Gens abzielt, zusammen mit der Streptococcus pyogenes Cas9-Nuklease. Die Plasmide kodieren zudem für GFP, was die fluoreszente Identifizierung und Anreicherung erfolgreich transfizierter Zellen mittels Fluoreszenzmikroskopie oder Durchflusszytometrie ermöglicht.

Das Multi-Guide-Design erhöht die Wahrscheinlichkeit, dass Insertionen oder Deletionen (Indels) entstehen, die den offenen Leserahmen von USP39 nach der Cas9-vermittelten Bildung von Doppelstrangbrüchen unterbrechen. Durch das CRISPR/Cas9-System verursachte DNA-Brüche werden über endogene NHEJ-Wege (Non-Homologous End Joining) repariert, was häufig zu Frameshift-Mutationen führt, die die USP39-Proteinexpression aufheben.

Dieses CRISPR-Knockout-System ermöglicht die effiziente Erzeugung von USP39-defizienten Zellmodellen zur Untersuchung der USP39-Signalübertragung, für funktionelle Genomstudien, in der Krebsbiologieforschung sowie zur Bewertung therapeutischer Reaktionen in menschlichen Zelllinien.

Hauptmerkmale

• sgRNAs, die auf USP39-Exone abzielen, die für die USP39-Funktion entscheidend sind
  Ko-Expression von SpCas9 und sgRNA aus einem einzigen Plasmid zur vereinfachten Verabreichung
  GFP-Reporter zur Identifizierung transfizierter Zellen
  Pool von Plasmiden, die auf mehrere USP39-Genomstellen abzielen, um die Knockout-Effizienz zu verbessern
  Kompatibel mit der Verabreichung durch Transfektion

Designvarianten

CRISPRs +/- HDRs

• gRNAs, die vom USP39 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h) und vom USP39 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h2) kodiert werden, zielen auf unterschiedliche Stellen innerhalb des USP39-Lokus ab. Es kann ein oder beide Targeting-Designs verfügbar sein. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.
  HDR-Donorkonstrukte, kodiert durch das USP39 HDR-Plasmid (h) und USP39 HDR-Plasmid (h2) kodiert, enthalten eine Puromycin-Resistenzkassette und einen RFP-Reporter, flankiert von USP39-Homologiearmen, um die homologe Reparatur an definierten USP39-Zielstellen entsprechend den CRISPR/Cas9-KO-Designs zu unterstützen. Die Verfügbarkeit von HDR-Donoren kann variieren. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.

Nur für Forschungszwecke. Nicht für diagnostische oder therapeutische Zwecke bestimmt.