Tris Acetate-EDTA buffer, 50X

Tris-Acetat-EDTA (TAE)-Puffer, der in seiner konzentrierten Form häufig als 50X TAE bezeichnet wird, ist eine in der Molekularbiologie weit verbreitete Pufferlösung, insbesondere für die elektrophoretische Trennung von Nukleinsäuren. Dieser Puffer besteht aus einer Mischung aus Tris-Base (Tris(hydroxymethyl)aminomethan), Essigsäure und EDTA (Ethylendiamintetraessigsäure). Die Hauptaufgabe des TAE-Puffers besteht darin, während der Elektrophorese einen stabilen pH-Wert aufrechtzuerhalten, was für die gleichmäßige Migration der DNA durch Agarosegele entscheidend ist. TAE-Puffer erleichtert die Bewegung der DNA unter einem elektrischen Feld durch die Bereitstellung von Ionen, die den Strom leiten und die Ladungsumgebung um die DNA-Moleküle stabilisieren. Die EDTA-Komponente des Puffers wirkt als Chelatbildner; sie bindet zweiwertige Metallionen wie Mg²⁺ und Ca²⁺, die als Cofaktoren für Nukleasen notwendig sind. Indem es diese Ionen sequestriert, hemmt EDTA die enzymatische Aktivität, die andernfalls während des Elektrophoreseprozesses Nukleinsäuren abbauen könnte. Die Forschungsanwendungen des TAE-Puffers sind nicht auf die einfache DNA-Gelelektrophorese beschränkt. Er wird auch bei differenzierteren molekularbiologischen Techniken wie der Pulsfeld-Gelelektrophorese (PFGE) und der Feldinversions-Gelelektrophorese (FIGE) eingesetzt, wo seine Pufferkapazität dazu beiträgt, die Veränderungen in der Ausrichtung und Stärke des elektrischen Feldes zu bewältigen und damit die Trennung sehr großer DNA-Fragmente zu unterstützen. Die etwas geringere Pufferkapazität von TAE im Vergleich zu anderen Puffern wie TBE (Tris-Borat-EDTA) kann bei diesen Anwendungen von Vorteil sein, da sie eine bessere Auflösung größerer DNA-Fragmente ermöglicht, allerdings um den Preis, dass der Puffer häufiger umgewälzt werden muss, um pH-Verschiebungen während längerer Läufe zu vermeiden.