TRIM41 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h): sc-413871

Übersicht

TRIM41 kodiert ein Protein mit tripartitem Motiv (TRIM) mit RING-Finger-E3-Ubiquitin-Ligase-Aktivität, das zur ubiquitinabhängigen Proteostase und zur Regulation von Signalkomplexen beiträgt. Als Teil von Netzwerken der TRIM-Familie ist TRIM41 an der Kontrolle von Proteinstabilität und -umsatz beteiligt und beeinflusst Signalwege, die mit der Regulation der angeborenen Immunantwort, Stressreaktionen und der Aufrechterhaltung der zellulären Homöostase verknüpft sind. Veränderte Ubiquitinierungsdynamiken unter Beteiligung von TRIM-Proteinen wurden mit fehlregulierter inflammatorischer Signalgebung und onkogenen Phänotypen in Verbindung gebracht, wodurch TRIM41 ein nützliches Ziel ist, um Beiträge des Ubiquitin-Systems zu krankheitsrelevanten Zellzuständen zu untersuchen. Die funktionelle Analyse von TRIM41 unterstützt Studien zur Substraterkennung, zum Crosstalk posttranslationaler Modifikationen sowie zu Effekten auf Signalweg-Ebene auf transkriptionelle und proteomische Outputs.

Das TRIM41 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h) ist ein Pool von Plasmiden, die für die gezielte Disruption des TRIM41-Gens in human-Zelllinien entwickelt wurden. Jedes Plasmid koexprimiert eine einzigartige Single-Guide-RNA (sgRNA), die auf eine bestimmte Stelle innerhalb des TRIM41-Gens abzielt, zusammen mit der Streptococcus pyogenes Cas9-Nuklease. Die Plasmide kodieren zudem für GFP, was die fluoreszente Identifizierung und Anreicherung erfolgreich transfizierter Zellen mittels Fluoreszenzmikroskopie oder Durchflusszytometrie ermöglicht.

Das Multi-Guide-Design erhöht die Wahrscheinlichkeit, dass Insertionen oder Deletionen (Indels) entstehen, die den offenen Leserahmen von TRIM41 nach der Cas9-vermittelten Bildung von Doppelstrangbrüchen unterbrechen. Durch das CRISPR/Cas9-System verursachte DNA-Brüche werden über endogene NHEJ-Wege (Non-Homologous End Joining) repariert, was häufig zu Frameshift-Mutationen führt, die die TRIM41-Proteinexpression aufheben.

Dieses CRISPR-Knockout-System ermöglicht die effiziente Erzeugung von TRIM41-defizienten Zellmodellen zur Untersuchung der TRIM41-Signalübertragung, für funktionelle Genomstudien, in der Krebsbiologieforschung sowie zur Bewertung therapeutischer Reaktionen in menschlichen Zelllinien.

Hauptmerkmale

• sgRNAs, die auf TRIM41-Exone abzielen, die für die TRIM41-Funktion entscheidend sind
  Ko-Expression von SpCas9 und sgRNA aus einem einzigen Plasmid zur vereinfachten Verabreichung
  GFP-Reporter zur Identifizierung transfizierter Zellen
  Pool von Plasmiden, die auf mehrere TRIM41-Genomstellen abzielen, um die Knockout-Effizienz zu verbessern
  Kompatibel mit der Verabreichung durch Transfektion

Designvarianten

CRISPRs +/- HDRs

• gRNAs, die vom TRIM41 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h) und vom TRIM41 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h2) kodiert werden, zielen auf unterschiedliche Stellen innerhalb des TRIM41-Lokus ab. Es kann ein oder beide Targeting-Designs verfügbar sein. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.
  HDR-Donorkonstrukte, kodiert durch das TRIM41 HDR-Plasmid (h) und TRIM41 HDR-Plasmid (h2) kodiert, enthalten eine Puromycin-Resistenzkassette und einen RFP-Reporter, flankiert von TRIM41-Homologiearmen, um die homologe Reparatur an definierten TRIM41-Zielstellen entsprechend den CRISPR/Cas9-KO-Designs zu unterstützen. Die Verfügbarkeit von HDR-Donoren kann variieren. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.

Nur für Forschungszwecke. Nicht für diagnostische oder therapeutische Zwecke bestimmt.