TNFα-IP 1 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (m): sc-423434

Übersicht

Tnfaip1 (TNFα-IP 1) kodiert ein durch TNFα induzierbares Protein, das an stressresponsiver Signalübertragung und der zellulären Homöostase beteiligt ist. Zu den beschriebenen Funktionen zählen Aufgaben in nukleären und zytoplasmatischen Prozessen, die den Zellzyklusverlauf, DNA-Schadensantworten und den Proteinumsatz beeinflussen, und damit TNF/NF-κB-assoziierte inflammatorische Signale mit nachgeschalteten Transkriptions- und Überlebensprogrammen verknüpfen. In Mausmodellen wird TNFα-IP 1 hinsichtlich seines Beitrags zur kontextabhängigen Regulation von Proliferation und Apoptose untersucht – Prozesse, die Gewebeumbau und immunologische Mikroumgebungen prägen. Eine Fehlregulation dieser Signalwege wird häufig in Modellen der Biologie entzündlicher Erkrankungen und tumorassoziierter Signalgebung untersucht, ohne daraus klinische Konsequenzen abzuleiten.

Das TNFα-IP 1 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (m) ist ein Pool von Plasmiden, die für die gezielte Disruption des Tnfaip1-Gens in mouse-Zelllinien entwickelt wurden. Jedes Plasmid koexprimiert eine einzigartige Single-Guide-RNA (sgRNA), die auf eine bestimmte Stelle innerhalb des Tnfaip1-Gens abzielt, zusammen mit der Streptococcus pyogenes Cas9-Nuklease. Die Plasmide kodieren zudem für GFP, was die fluoreszente Identifizierung und Anreicherung erfolgreich transfizierter Zellen mittels Fluoreszenzmikroskopie oder Durchflusszytometrie ermöglicht.

Das Multi-Guide-Design erhöht die Wahrscheinlichkeit, dass Insertionen oder Deletionen (Indels) entstehen, die den offenen Leserahmen von Tnfaip1 nach der Cas9-vermittelten Bildung von Doppelstrangbrüchen unterbrechen. Durch das CRISPR/Cas9-System verursachte DNA-Brüche werden über endogene NHEJ-Wege (Non-Homologous End Joining) repariert, was häufig zu Frameshift-Mutationen führt, die die TNFα-IP 1-Proteinexpression aufheben.

Dieses CRISPR-Knockout-System ermöglicht die effiziente Erzeugung von Tnfaip1-defizienten Zellmodellen zur Untersuchung der TNFα-IP 1-Signalübertragung, für funktionelle Genomstudien, in der Krebsbiologieforschung sowie zur Bewertung therapeutischer Reaktionen in menschlichen Zelllinien.

Hauptmerkmale

• sgRNAs, die auf Tnfaip1-Exone abzielen, die für die TNFα-IP 1-Funktion entscheidend sind
  Ko-Expression von SpCas9 und sgRNA aus einem einzigen Plasmid zur vereinfachten Verabreichung
  GFP-Reporter zur Identifizierung transfizierter Zellen
  Pool von Plasmiden, die auf mehrere Tnfaip1-Genomstellen abzielen, um die Knockout-Effizienz zu verbessern
  Kompatibel mit der Verabreichung durch Transfektion

Designvarianten

CRISPRs +/- HDRs

• gRNAs, die vom TNFα-IP 1 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (m) und vom TNFα-IP 1 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (m2) kodiert werden, zielen auf unterschiedliche Stellen innerhalb des Tnfaip1-Lokus ab. Es kann ein oder beide Targeting-Designs verfügbar sein. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.
  HDR-Donorkonstrukte, kodiert durch das TNFα-IP 1 HDR-Plasmid (m) und TNFα-IP 1 HDR-Plasmid (m2) kodiert, enthalten eine Puromycin-Resistenzkassette und einen RFP-Reporter, flankiert von Tnfaip1-Homologiearmen, um die homologe Reparatur an definierten Tnfaip1-Zielstellen entsprechend den CRISPR/Cas9-KO-Designs zu unterstützen. Die Verfügbarkeit von HDR-Donoren kann variieren. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.

Nur für Forschungszwecke. Nicht für diagnostische oder therapeutische Zwecke bestimmt.