Synoviolin CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h): sc-403476
- Zielspezies: human
- 20 µg transfektionsfertige, aufgereinigte Plasmid DNA; geeignet für 20 Transfektionen
- Synoviolin Das CRISPR/Cas9-Knockout (KO)-Plasmid (h) ist ein Pool von Plasmiden, von denen jedes für die Cas9-Nuklease und eine zielspezifische 20-nt-Guide-RNA (gRNA) kodiert, die für maximale Knockout-Effizienz unter Verwendung von Sequenzen aus der GeCKO v2-Bibliothek entwickelt wurde
- gRNA-Sequenzen lenken Cas9 so, dass es ortsspezifische Doppelstrangbrüche (DSBs) im Synoviolin-Genomlokus induziert, was zu einem Gen-Knockout durch nicht-homologe Endverknüpfung (NHEJ) führt
- Die Puromycin-Resistenz- und RFP-Gene werden von LoxP-Stellen flankiert, was die Entfernung der Selektionsmarker mittels Cre-Rekombinase (Cre-Vektor: sc-418923) nach der Etablierung stabiler Knockout-Zelllinien ermöglicht
- Nach der Transfektion kann die Effizienz des Gen-Knockouts per Western Blot oder histologisch mit folgendem Antikörper überprüft werden: Synoviolin: sc-293484
Bestellinformation
| Produkt | Katalog # | EINHEIT | Preis | ANZAHL | Favoriten | |
Synoviolin CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h) | sc-403476 | 20 µg | $397.00 |
Übersicht
Das menschliche SYVN1-Gen kodiert Synoviolin, eine im endoplasmatischen Retikulum (ER) lokalisierte RING-Typ-E3-Ubiquitin-Ligase, die als zentrale Komponente der ER-assoziierten Degradation (ERAD) fehlgefaltete Proteine ubiquitiniert und deren proteasomalen Abbau fördert. Über die ER-Proteinqualitätskontrolle trägt Synoviolin zur Aufrechterhaltung der Proteostase bei und moduliert die Signalübertragung der „unfolded protein response“, wodurch ER-Stress mit nachgeschalteten Entzündungs- und Überlebenswegen verknüpft wird. Die SYVN1-Aktivität wird zudem mit der Regulation von Apoptose und Zellzykluskontrolle in Verbindung gebracht – über den ubiquitinabhängigen Umsatz zentraler Substrate – und beeinflusst so die zelluläre Anpassung an chronischen Stress. Eine fehlregulierte SYVN1-Expression bzw. ERAD-Kapazität ist an krankheitsrelevanten Mechanismen beteiligt, darunter synoviale Hyperplasie und entzündliche Gelenkpathologie, sowie allgemeinere Kontexte eines Ungleichgewichts der Proteostase.
Das Synoviolin CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h) ist ein Pool von Plasmiden, die für die gezielte Disruption des SYVN1-Gens in human-Zelllinien entwickelt wurden. Jedes Plasmid koexprimiert eine einzigartige Single-Guide-RNA (sgRNA), die auf eine bestimmte Stelle innerhalb des SYVN1-Gens abzielt, zusammen mit der Streptococcus pyogenes Cas9-Nuklease. Die Plasmide kodieren zudem für GFP, was die fluoreszente Identifizierung und Anreicherung erfolgreich transfizierter Zellen mittels Fluoreszenzmikroskopie oder Durchflusszytometrie ermöglicht.
Das Multi-Guide-Design erhöht die Wahrscheinlichkeit, dass Insertionen oder Deletionen (Indels) entstehen, die den offenen Leserahmen von SYVN1 nach der Cas9-vermittelten Bildung von Doppelstrangbrüchen unterbrechen. Durch das CRISPR/Cas9-System verursachte DNA-Brüche werden über endogene NHEJ-Wege (Non-Homologous End Joining) repariert, was häufig zu Frameshift-Mutationen führt, die die Synoviolin-Proteinexpression aufheben.
Dieses CRISPR-Knockout-System ermöglicht die effiziente Erzeugung von SYVN1-defizienten Zellmodellen zur Untersuchung der Synoviolin-Signalübertragung, für funktionelle Genomstudien, in der Krebsbiologieforschung sowie zur Bewertung therapeutischer Reaktionen in menschlichen Zelllinien.
Hauptmerkmale
- sgRNAs, die auf SYVN1-Exone abzielen, die für die Synoviolin-Funktion entscheidend sind
Ko-Expression von SpCas9 und sgRNA aus einem einzigen Plasmid zur vereinfachten Verabreichung
GFP-Reporter zur Identifizierung transfizierter Zellen
Pool von Plasmiden, die auf mehrere SYVN1-Genomstellen abzielen, um die Knockout-Effizienz zu verbessern
Kompatibel mit der Verabreichung durch Transfektion
Designvarianten
CRISPRs +/- HDRs
- gRNAs, die vom Synoviolin CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h) und vom Synoviolin CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h2) kodiert werden, zielen auf unterschiedliche Stellen innerhalb des SYVN1-Lokus ab. Es kann ein oder beide Targeting-Designs verfügbar sein. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.
HDR-Donorkonstrukte, kodiert durch das Synoviolin HDR-Plasmid (h) und Synoviolin HDR-Plasmid (h2) kodiert, enthalten eine Puromycin-Resistenzkassette und einen RFP-Reporter, flankiert von SYVN1-Homologiearmen, um die homologe Reparatur an definierten SYVN1-Zielstellen entsprechend den CRISPR/Cas9-KO-Designs zu unterstützen. Die Verfügbarkeit von HDR-Donoren kann variieren. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.
Nur für Forschungszwecke. Nicht für diagnostische oder therapeutische Zwecke bestimmt.