SURF-6 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (m): sc-423223

Übersicht

Surf6 kodiert SURF-6, ein konserviertes nukleoläres Protein, das über Funktionen in der prä‑rRNA‑Prozessierung und der Reifung ribosomaler Untereinheiten an der Ribosomenbiogenese und der Homöostase des Nukleolus beteiligt ist. SURF-6 wirkt bei RNA-Bindungs- und Nukleolus-Organisationsprozessen mit, die die Kapazität der Proteinsynthese mit Programmen für Zellwachstum und Proliferation koordinieren. Störungen der Nukleolusfunktion und der Ribosomenproduktion sind eng mit zellulären Stressantworten, veränderter Translation und Proliferationsdefekten verknüpft, wodurch Surf6 für Studien zur Genomstabilität und Wachstumskontrolle in Säugersystemen relevant ist. In Mausmodellen bietet eine Beeinflussung von Surf6 einen gut handhabbaren Ansatzpunkt, um zu untersuchen, wie die Ribosomenbiogenese mit Entwicklungsphänotypen und krankheitsassoziierten Fehlregulationen nukleolärer Signalwege zusammenhängt.

Das SURF-6 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (m) ist ein Pool von Plasmiden, die für die gezielte Disruption des Surf6-Gens in mouse-Zelllinien entwickelt wurden. Jedes Plasmid koexprimiert eine einzigartige Single-Guide-RNA (sgRNA), die auf eine bestimmte Stelle innerhalb des Surf6-Gens abzielt, zusammen mit der Streptococcus pyogenes Cas9-Nuklease. Die Plasmide kodieren zudem für GFP, was die fluoreszente Identifizierung und Anreicherung erfolgreich transfizierter Zellen mittels Fluoreszenzmikroskopie oder Durchflusszytometrie ermöglicht.

Das Multi-Guide-Design erhöht die Wahrscheinlichkeit, dass Insertionen oder Deletionen (Indels) entstehen, die den offenen Leserahmen von Surf6 nach der Cas9-vermittelten Bildung von Doppelstrangbrüchen unterbrechen. Durch das CRISPR/Cas9-System verursachte DNA-Brüche werden über endogene NHEJ-Wege (Non-Homologous End Joining) repariert, was häufig zu Frameshift-Mutationen führt, die die SURF-6-Proteinexpression aufheben.

Dieses CRISPR-Knockout-System ermöglicht die effiziente Erzeugung von Surf6-defizienten Zellmodellen zur Untersuchung der SURF-6-Signalübertragung, für funktionelle Genomstudien, in der Krebsbiologieforschung sowie zur Bewertung therapeutischer Reaktionen in menschlichen Zelllinien.

Hauptmerkmale

• sgRNAs, die auf Surf6-Exone abzielen, die für die SURF-6-Funktion entscheidend sind
  Ko-Expression von SpCas9 und sgRNA aus einem einzigen Plasmid zur vereinfachten Verabreichung
  GFP-Reporter zur Identifizierung transfizierter Zellen
  Pool von Plasmiden, die auf mehrere Surf6-Genomstellen abzielen, um die Knockout-Effizienz zu verbessern
  Kompatibel mit der Verabreichung durch Transfektion

Designvarianten

CRISPRs +/- HDRs

• gRNAs, die vom SURF-6 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (m) und vom SURF-6 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (m2) kodiert werden, zielen auf unterschiedliche Stellen innerhalb des Surf6-Lokus ab. Es kann ein oder beide Targeting-Designs verfügbar sein. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.
  HDR-Donorkonstrukte, kodiert durch das SURF-6 HDR-Plasmid (m) und SURF-6 HDR-Plasmid (m2) kodiert, enthalten eine Puromycin-Resistenzkassette und einen RFP-Reporter, flankiert von Surf6-Homologiearmen, um die homologe Reparatur an definierten Surf6-Zielstellen entsprechend den CRISPR/Cas9-KO-Designs zu unterstützen. Die Verfügbarkeit von HDR-Donoren kann variieren. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.

Nur für Forschungszwecke. Nicht für diagnostische oder therapeutische Zwecke bestimmt.