Suc-LLVY-AMC

Suc-LLVY-AMC ist ein empfindliches fluorogenes Substrat für das 20S-Proteasom, Calpaine und andere chymotrypsin-ähnliche Proteasen. Das nicht fluoreszierende Substrat erzeugt ein hellblau fluoreszierendes AMC-Produkt mit Ex/Em = 351/430 nm, das leicht mit dem DAPI-Filter-Set nachgewiesen werden kann. Die häufigste Form des Proteasoms ist als 26S-Proteasom bekannt und enthält eine 20S-Kernpartikelstruktur sowie zwei 19S-Regulierungskappen. Alle 20S-Partikel bestehen aus vier gestapelten heptameren Ringstrukturen, die selbst aus zwei verschiedenen Arten von Untereinheiten bestehen: Alpha-Untereinheiten sind struktureller Natur, während Beta-Untereinheiten überwiegend katalytisch sind. Die äußeren beiden Ringe im Stapel bestehen jeweils aus sieben Alpha-Untereinheiten, die als Andockdomänen für die Regulierungspartikel dienen, und die N-Termini der Alpha-Untereinheiten bilden ein Tor, das den unregulierten Zugang von Substraten zur inneren Höhle blockiert. Die inneren beiden Ringe bestehen jeweils aus sieben Beta-Untereinheiten und enthalten die proteolytischen Aktivzentren, die die Proteolyse-Reaktionen durchführen. Suc-LLVY-AMC ist ein synthetisches Peptid-Substrat, das häufig in biochemischen und enzymatischen Assays verwendet wird, um die Aktivität von Proteasom-Enzymen zu messen. Der Name "Suc-LLVY-AMC" steht für Succinyl-Leu-Leu-Val-Tyr-7-amino-4-methylcoumarin, was die Sequenz und Struktur des Substrats repräsentiert.