Sox-17 Double Nickase Plasmid (h): sc-401192-NIC
- Zielspezies: human
- 20 µg transfektionsfertige, aufgereinigte Plasmid DNA; geeignet für 20 Transfektionen
- Das Sox-17 Double Nickase Plasmid (h) wird als Plasmid-Paar geliefert. Die einzelnen Plasmide kodieren für eine D10A mutierte Cas9 Nuklease sowie für je eine unterschiedliche, zielspezifische 20nt guide RNA (gRNA) Sequenz. Dies erlaubt eine hohe Knockout-Effizienz bei gleichzeitig größerer Spezifität als das entsprechende CRISPR/Cas9 KO Plasmid
- gRNA Sequenzpaare liegen ca. 20 bp auseinander um ein spezifisches Cas9-vermitteltes "Double Nicking" der genomischen DNA zu erlauben und so im Resultat den Effekt eines Doppelstrangbruchs nachzuahmen.
- Ein Plasmid kodiert für ein Puromycin-Resistenzgen zur Selektion von stabilen Knockout-Zellen. Das andere Plasmid kodiert für ein GFP-Gen für den visuellen Nachweis der Transfektion
- Sox-17 Double-Nickase-Plasmid (h) und Sox-17 Double-Nickase-Plasmid (h2) kodieren unterschiedliche gepaarte gRNA-Designs, die auf SOX17 abzielen. Möglicherweise ist eines oder sind beide Designs verfügbar
Bestellinformation
| Produkt | Katalog # | EINHEIT | Preis | ANZAHL | Favoriten | |
Sox-17 Double Nickase Plasmid (h) | sc-401192-NIC | 20 µg | $410.00 | |||
Sox-17 Double Nickase Plasmid (h2) | sc-401192-NIC-2 | 20 µg | $410.00 |
SOX17 kodiert den Transkriptionsfaktor Sox-17, ein High-Mobility-Group-(HMG)-Box-Protein, das während der frühen Entwicklung und der Endodermbildung die Festlegung von Zelllinien reguliert. Sox-17 ist an Transkriptionsprogrammen beteiligt, die sich mit der Wnt/β-Catenin- und der TGF-β/SMAD-Signalgebung überschneiden, und beeinflusst so Entscheidungen über das Zellschicksal, die epitheliale Differenzierung und die Musterbildung von Geweben. Im adulten Kontext trägt SOX17 zur Genregulation in Gefäßen und der Lunge bei und kann über die Modulation entwicklungsbiologischer Transkriptionsnetzwerke die Identität epithelialer Zellen beeinflussen. Eine fehlregulierte SOX17-Expression oder epigenetische Stilllegung wurde bei mehreren Tumortypen beschrieben und wird aufgrund ihrer Zusammenhänge mit aberranter Differenzierung, invasionsassoziierten Programmen und einer Umverdrahtung von Signalwegen in onkogenen Kontexten untersucht.
Sox-17 Das Double-Nickase-Plasmid (h) besteht aus einem aufeinander abgestimmten Plasmidpaar, das für die hochspezifische Bearbeitung des SOX17-Lokus in human-Zelllinien entwickelt wurde. Jedes Plasmid exprimiert eine Cas9-D10A-Nickase und eine spezifische sgRNA, die auf entgegengesetzte DNA-Stränge innerhalb von SOX17 abzielt. Wenn sie auf benachbarte Stellen auf entgegengesetzten DNA-Strängen gerichtet sind, erzeugen die beiden Nickasen versetzte Einzelstrang-Schnitte, die zusammen einen versetzten Doppelstrangbruch erzeugen, was eine koordinierte On-Target-Aktivität beider Guides erfordert. Der resultierende DNA-Bruch wird durch endogene zelluläre Reparaturwege behoben, meist durch nicht-homologe Endverknüpfung (NHEJ), was zu Insertionen oder Deletionen führt, die die SOX17-Funktion stören. Durch die Notwendigkeit einer doppelten sgRNA-Bindung am Zielort erhöht der Doppel-Nick-Ansatz die Spezifität der Bearbeitung und bietet eine komplementäre CRISPR-Strategie für Anwendungen, bei denen eine zusätzliche Kontrolle über die Zielgenauigkeit gewünscht ist.
Um eine effiziente Identifizierung editierter Zellen zu unterstützen, kodiert ein Plasmid GFP zur fluoreszierenden Visualisierung transfizierter Populationen, während das Begleitplasmid ein Puromycin-Resistenzgen für die Antibiotika-Selektion trägt. Zusammen unterstützen diese Merkmale eine effiziente Anreicherung co-transfizierter Populationen und vereinfachen die Validierung von Klonen mit SOX17-Störung.
Nur für Forschungszwecke. Nicht für diagnostische oder therapeutische Zwecke bestimmt.