SNX9 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (m): sc-426112

Übersicht

Snx9 kodiert Sorting Nexin 9 (SNX9), ein Adapterprotein mit SH3- und PX-Domäne, das die Bindung von Phosphoinositiden mit Membranumbau und clathrinvermittelter Endozytose verknüpft. SNX9 koordiniert den Zusammenbau der endozytotischen und aktinregulierenden Maschinerie durch Interaktion mit Dynamin und N-WASP und unterstützt dadurch Vesikelabschnürung, Rezeptor-Internalisierung und Membrantransport an der Plasmamembran. Über diese Funktionen beeinflusst SNX9 die Signaldynamik nachgeschalteter, internalisierter Rezeptoren und trägt zur Umorganisation des Zytoskeletts bei, etwa bei Zellmigration und Membranumsatz. Eine Fehlregulation des endozytotischen Traffickings und der Aktinkontrolle wird mit krebsassoziierter Signalgebung und neurobiologischen Phänotypen in Verbindung gebracht, wodurch Snx9 einen nützlichen Ansatzpunkt für mechanistische Studien zur Umverdrahtung von Signalwegen in krankheitsrelevanten Kontexten darstellt.

Das SNX9 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (m) ist ein Pool von Plasmiden, die für die gezielte Disruption des Snx9-Gens in mouse-Zelllinien entwickelt wurden. Jedes Plasmid koexprimiert eine einzigartige Single-Guide-RNA (sgRNA), die auf eine bestimmte Stelle innerhalb des Snx9-Gens abzielt, zusammen mit der Streptococcus pyogenes Cas9-Nuklease. Die Plasmide kodieren zudem für GFP, was die fluoreszente Identifizierung und Anreicherung erfolgreich transfizierter Zellen mittels Fluoreszenzmikroskopie oder Durchflusszytometrie ermöglicht.

Das Multi-Guide-Design erhöht die Wahrscheinlichkeit, dass Insertionen oder Deletionen (Indels) entstehen, die den offenen Leserahmen von Snx9 nach der Cas9-vermittelten Bildung von Doppelstrangbrüchen unterbrechen. Durch das CRISPR/Cas9-System verursachte DNA-Brüche werden über endogene NHEJ-Wege (Non-Homologous End Joining) repariert, was häufig zu Frameshift-Mutationen führt, die die SNX9-Proteinexpression aufheben.

Dieses CRISPR-Knockout-System ermöglicht die effiziente Erzeugung von Snx9-defizienten Zellmodellen zur Untersuchung der SNX9-Signalübertragung, für funktionelle Genomstudien, in der Krebsbiologieforschung sowie zur Bewertung therapeutischer Reaktionen in menschlichen Zelllinien.

Hauptmerkmale

• sgRNAs, die auf Snx9-Exone abzielen, die für die SNX9-Funktion entscheidend sind
  Ko-Expression von SpCas9 und sgRNA aus einem einzigen Plasmid zur vereinfachten Verabreichung
  GFP-Reporter zur Identifizierung transfizierter Zellen
  Pool von Plasmiden, die auf mehrere Snx9-Genomstellen abzielen, um die Knockout-Effizienz zu verbessern
  Kompatibel mit der Verabreichung durch Transfektion

Designvarianten

CRISPRs +/- HDRs

• gRNAs, die vom SNX9 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (m) und vom SNX9 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (m2) kodiert werden, zielen auf unterschiedliche Stellen innerhalb des Snx9-Lokus ab. Es kann ein oder beide Targeting-Designs verfügbar sein. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.
  HDR-Donorkonstrukte, kodiert durch das SNX9 HDR-Plasmid (m) und SNX9 HDR-Plasmid (m2) kodiert, enthalten eine Puromycin-Resistenzkassette und einen RFP-Reporter, flankiert von Snx9-Homologiearmen, um die homologe Reparatur an definierten Snx9-Zielstellen entsprechend den CRISPR/Cas9-KO-Designs zu unterstützen. Die Verfügbarkeit von HDR-Donoren kann variieren. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.

Nur für Forschungszwecke. Nicht für diagnostische oder therapeutische Zwecke bestimmt.