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SMARCD2 CRISPR Activationプラスミド (h) | sc-403091-ACT | 20 µg | $397.00 |
SMARCD2(別名BAF60B)は、配列特異的転写因子による作用とヌクレオソーム再配置とを結び付けるのに寄与する、ATP依存性クロマチンリモデリング複合体SWI/SNF(BAF)の中核的な補助サブユニットをコードしています。クロマチンのアクセシビリティを調節することで、SMARCD2は造血分化、免疫細胞の成熟、刺激応答性遺伝子の発現を制御する系譜特異的な転写プログラムに影響を与えます。このクロマチンリモデリング活性は、発生過程やストレス応答にわたって、転写開始、エンハンサー機能、エピジェネティック状態の維持を司る経路と統合的に働きます。SWI/SNFサブユニットの量や機能の異常は、分化の破綻やがん化に関わる転写回路の異常と広く関連しており、SMARCD2はクロマチン駆動性の疾患生物学を機構的に研究するうえで有用な標的となります。
SMARCD2 CRISPR活性化プラスミド(h)は、基盤となるDNA配列を変更することなく、内因性SMARCD2の発現を標的化し、非破壊的にアップレギュレートするアプローチを提供します。
SMARCD2 CRISPR 活性化プラスミド (h) は、ヒト細胞株における SMARCD2 遺伝子座の高効率かつ部位特異的な転写アップレギュレーションのために設計された、3 つのプラスミドからなる相乗的活性化メディエーター (SAM) システムです。このシステムは、DNA結合能を維持しつつヌクレアーゼ活性を失わせる2つの不活性化変異(D10AおよびN863A)を有する、触媒活性のないCas9(dCas9)を中核としています。このdCas9は、強力な転写活性化因子であるVP64と融合しており、選別用のブラスティシジン耐性遺伝子と共に共発現します。2番目のプラスミドは、dCas9-VP64と協調して機能する二次活性化複合体であるMS2-p65-HSF1融合タンパク質をコードしており、ヒグロマイシン耐性遺伝子と共に発現する。3番目のプラスミドは、標的特異的な20塩基対のsgRNAをコードしており、これはMS2-p65-HSF1複合体を活性化部位に誘導する2つのMS2 RNAアプタマーと融合しており、さらにピューロマイシン耐性遺伝子が付随している。これら3つのプラスミドは、システム構成要素すべてが均等に発現するよう、質量比1:1:1で導入される。
標的遺伝子座に集合すると、SAM複合体はSMARCD2転写開始点の上流約200 bpの領域に結合し、そこでVP64、p65、およびHSF1が協調して転写装置を動員し、内因性SMARCD2の発現上昇を促進する。ヌクレアーゼ活性を持つCas9とは異なり、 dCas9は二本鎖切断を導入したりゲノム配列を改変したりしないため、天然のSMARCD2遺伝子座が保持され、内因性遺伝子座におけるSMARCD2依存性の転写応答の研究が可能となります。これにより、機能解析、標的遺伝子の同定、およびSMARCD2発現が沈黙または低下した腫瘍細胞におけるSMARCD2経路の回復のモデル化を行う上で、貴重なツールとなります。
研究用のみ。診断用または治療用ではありません。