PTPN21 CRISPR/Cas9 KOプラスミド (h): sc-407466

概要

PTPN21は、細胞質に局在するタンパク質チロシンホスファターゼをコードしており、特定の基質や足場タンパク質を脱リン酸化することで、リン酸化依存的なシグナル伝達を調節します。受容体型チロシンキナーゼの出力や、細胞骨格ダイナミクス、接着、小胞輸送を制御する下流経路の調節を通じて、PTPN21は細胞運動性やシグナルの強度に影響を及ぼし得ます。その活性は、増殖因子応答やストレスシグナルを司るネットワークとも交差するため、細胞形質転換や浸潤性表現型の研究において重要です。PTPN21が関与するホスファターゼシグナルの破綻は、がんに関連したシグナル伝達の再配線や、遊走挙動の変化といった文脈で示唆されています。

PTPN21 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）は、human細胞株におけるPTPN21遺伝子の標的破壊を目的として設計されたプラスミドのプールである。各プラスミドは、PTPN21内の異なる部位を標的とする固有のシングルガイドRNA（sgRNA）と、Streptococcus pyogenes由来のCas9ヌクレアーゼを共発現します。また、これらのプラスミドはGFPをコードしており、蛍光顕微鏡やフローサイトメトリーを用いて、トランスフェクションに成功した細胞を蛍光で識別・濃縮することが可能です。

このマルチガイド設計により、Cas9による二本鎖切断の形成後に、PTPN21のオープンリーディングフレームを破壊する挿入または欠失（インデル）が生じる可能性が高まります。CRISPR/Cas9システムによって導入されたDNA切断は、内因性の非相同末端結合（NHEJ）経路を通じて修復され、その結果、PTPN21タンパク質の発現を阻害するフレームシフト変異が生じることが頻繁にあります。

このCRISPRノックアウトシステムにより、PTPN21シグナル伝達、機能ゲノミクス研究、がん生物学研究、およびヒト細胞株における治療反応の評価を目的とした、PTPN21欠損細胞モデルの効率的な作製が可能となる。

主な特徴

• PTPN21の機能に不可欠なPTPN21エクソンを標的とするsgRNA
  導入を簡素化するための、単一プラスミドからのSpCas9およびsgRNAの共発現
  トランスフェクトされた細胞を識別するためのGFPレポーター
  ノックアウト効率を向上させるための、PTPN21ゲノム上の複数の部位を標的とするプラスミドのプール
  トランスフェクションによる導入に対応

設計バリエーション

CRISPRs +/- HDR

• PTPN21 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）およびPTPN21 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h2）によってコードされるgRNAは、PTPN21遺伝子座内の異なる部位を標的としています。いずれか一方、または両方の標的設計が利用可能な場合があります。入手可能性については「関連製品」を参照してください。
  PTPN21 HDRプラスミド（h）および PTPN21 HDRプラスミド（h2）によってコードされるHDRドナー構築体は、プロマイシン耐性カセットとRFPレポーターを含み、これらはPTPN21ホモロジーアームに挟まれており、CRISPR/Cas9 KO設計に対応する特定のPTPN21標的部位でのホモロジー依存修復をサポートします。HDRドナーの入手可能性は異なる場合があります。入手可能性については「関連製品」をご確認ください。

研究用のみ。診断用または治療用ではありません。