PTPN21 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h): sc-407466

Übersicht

PTPN21 kodiert eine zytosolische Protein-Tyrosinphosphatase, die phosphorylierungsabhängige Signalwege moduliert, indem sie spezifische Substrate und Scaffold-Proteine dephosphoryliert. Durch die Regulation von Rezeptor-Tyrosinkinasen und nachgeschalteten Signalwegen, die Zytoskelettdynamik, Adhäsion und vesikulären Transport steuern, kann PTPN21 die Zellmotilität und die Signalstärke beeinflussen. Seine Aktivität ist in Netzwerke eingebunden, die Wachstumsfaktorantworten und Stresssignale regulieren, was PTPN21 für Untersuchungen zu zellulärer Transformation und invasiven Phänotypen relevant macht. Eine fehlregulierte Phosphatase-Signalgebung unter Beteiligung von PTPN21 wurde in Zusammenhängen wie krebsassoziiertem Rewiring von Signalwegen und verändertem Migrationsverhalten beschrieben.

Das PTPN21 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h) ist ein Pool von Plasmiden, die für die gezielte Disruption des PTPN21-Gens in human-Zelllinien entwickelt wurden. Jedes Plasmid koexprimiert eine einzigartige Single-Guide-RNA (sgRNA), die auf eine bestimmte Stelle innerhalb des PTPN21-Gens abzielt, zusammen mit der Streptococcus pyogenes Cas9-Nuklease. Die Plasmide kodieren zudem für GFP, was die fluoreszente Identifizierung und Anreicherung erfolgreich transfizierter Zellen mittels Fluoreszenzmikroskopie oder Durchflusszytometrie ermöglicht.

Das Multi-Guide-Design erhöht die Wahrscheinlichkeit, dass Insertionen oder Deletionen (Indels) entstehen, die den offenen Leserahmen von PTPN21 nach der Cas9-vermittelten Bildung von Doppelstrangbrüchen unterbrechen. Durch das CRISPR/Cas9-System verursachte DNA-Brüche werden über endogene NHEJ-Wege (Non-Homologous End Joining) repariert, was häufig zu Frameshift-Mutationen führt, die die PTPN21-Proteinexpression aufheben.

Dieses CRISPR-Knockout-System ermöglicht die effiziente Erzeugung von PTPN21-defizienten Zellmodellen zur Untersuchung der PTPN21-Signalübertragung, für funktionelle Genomstudien, in der Krebsbiologieforschung sowie zur Bewertung therapeutischer Reaktionen in menschlichen Zelllinien.

Hauptmerkmale

• sgRNAs, die auf PTPN21-Exone abzielen, die für die PTPN21-Funktion entscheidend sind
  Ko-Expression von SpCas9 und sgRNA aus einem einzigen Plasmid zur vereinfachten Verabreichung
  GFP-Reporter zur Identifizierung transfizierter Zellen
  Pool von Plasmiden, die auf mehrere PTPN21-Genomstellen abzielen, um die Knockout-Effizienz zu verbessern
  Kompatibel mit der Verabreichung durch Transfektion

Designvarianten

CRISPRs +/- HDRs

• gRNAs, die vom PTPN21 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h) und vom PTPN21 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h2) kodiert werden, zielen auf unterschiedliche Stellen innerhalb des PTPN21-Lokus ab. Es kann ein oder beide Targeting-Designs verfügbar sein. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.
  HDR-Donorkonstrukte, kodiert durch das PTPN21 HDR-Plasmid (h) und PTPN21 HDR-Plasmid (h2) kodiert, enthalten eine Puromycin-Resistenzkassette und einen RFP-Reporter, flankiert von PTPN21-Homologiearmen, um die homologe Reparatur an definierten PTPN21-Zielstellen entsprechend den CRISPR/Cas9-KO-Designs zu unterstützen. Die Verfügbarkeit von HDR-Donoren kann variieren. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.

Nur für Forschungszwecke. Nicht für diagnostische oder therapeutische Zwecke bestimmt.