PHF3 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h): sc-406857

Übersicht

PHF3 (PHD-Finger-Protein 3) ist ein nukleärer Transkriptionsregulator, der mit der RNA-Polymerase II assoziiert und zur Kontrolle der Transkriptionselongation sowie der kotranskriptionellen RNA-Prozessierung beiträgt. Über seine PHD-Finger-Domänen und Interaktionen mit der Elongationsmaschinerie beeinflusst PHF3 Genexpressionsprogramme, die mit der Aufrechterhaltung des Zellzustands und einer reizabhängigen Transkription verknüpft sind. Eine Störung der PHF3-Aktivität wurde mit veränderter Transkriptionsgenauigkeit und dysregulierten Netzwerken der Wachstumskontrolle in Verbindung gebracht, wodurch PHF3 für die Untersuchung von Mechanismen relevant ist, die chromatinassoziierte Faktoren mit der RNA-Synthese koppeln. PHF3 ist daher von Interesse für Forschungsbereiche, die Genregulation, Differenzierung und krankheitsassoziierte Transkriptions-Neuverdrahtung umfassen.

Das PHF3 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h) ist ein Pool von Plasmiden, die für die gezielte Disruption des PHF3-Gens in human-Zelllinien entwickelt wurden. Jedes Plasmid koexprimiert eine einzigartige Single-Guide-RNA (sgRNA), die auf eine bestimmte Stelle innerhalb des PHF3-Gens abzielt, zusammen mit der Streptococcus pyogenes Cas9-Nuklease. Die Plasmide kodieren zudem für GFP, was die fluoreszente Identifizierung und Anreicherung erfolgreich transfizierter Zellen mittels Fluoreszenzmikroskopie oder Durchflusszytometrie ermöglicht.

Das Multi-Guide-Design erhöht die Wahrscheinlichkeit, dass Insertionen oder Deletionen (Indels) entstehen, die den offenen Leserahmen von PHF3 nach der Cas9-vermittelten Bildung von Doppelstrangbrüchen unterbrechen. Durch das CRISPR/Cas9-System verursachte DNA-Brüche werden über endogene NHEJ-Wege (Non-Homologous End Joining) repariert, was häufig zu Frameshift-Mutationen führt, die die PHF3-Proteinexpression aufheben.

Dieses CRISPR-Knockout-System ermöglicht die effiziente Erzeugung von PHF3-defizienten Zellmodellen zur Untersuchung der PHF3-Signalübertragung, für funktionelle Genomstudien, in der Krebsbiologieforschung sowie zur Bewertung therapeutischer Reaktionen in menschlichen Zelllinien.

Hauptmerkmale

• sgRNAs, die auf PHF3-Exone abzielen, die für die PHF3-Funktion entscheidend sind
  Ko-Expression von SpCas9 und sgRNA aus einem einzigen Plasmid zur vereinfachten Verabreichung
  GFP-Reporter zur Identifizierung transfizierter Zellen
  Pool von Plasmiden, die auf mehrere PHF3-Genomstellen abzielen, um die Knockout-Effizienz zu verbessern
  Kompatibel mit der Verabreichung durch Transfektion

Designvarianten

CRISPRs +/- HDRs

• gRNAs, die vom PHF3 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h) und vom PHF3 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h2) kodiert werden, zielen auf unterschiedliche Stellen innerhalb des PHF3-Lokus ab. Es kann ein oder beide Targeting-Designs verfügbar sein. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.
  HDR-Donorkonstrukte, kodiert durch das PHF3 HDR-Plasmid (h) und PHF3 HDR-Plasmid (h2) kodiert, enthalten eine Puromycin-Resistenzkassette und einen RFP-Reporter, flankiert von PHF3-Homologiearmen, um die homologe Reparatur an definierten PHF3-Zielstellen entsprechend den CRISPR/Cas9-KO-Designs zu unterstützen. Die Verfügbarkeit von HDR-Donoren kann variieren. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.

Nur für Forschungszwecke. Nicht für diagnostische oder therapeutische Zwecke bestimmt.