Date published: 2026-10-28

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PB1 Double Nickase Plasmid (m): sc-426270-NIC

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Datenblätter
  • Zielspezies: mouse
  • 20 µg transfektionsfertige, aufgereinigte Plasmid DNA; geeignet für 20 Transfektionen
  • Das PB1 Double Nickase Plasmid (m) wird als Plasmid-Paar geliefert. Die einzelnen Plasmide kodieren für eine D10A mutierte Cas9 Nuklease sowie für je eine unterschiedliche, zielspezifische 20nt guide RNA (gRNA) Sequenz. Dies erlaubt eine hohe Knockout-Effizienz bei gleichzeitig größerer Spezifität als das entsprechende CRISPR/Cas9 KO Plasmid
  • gRNA Sequenzpaare liegen ca. 20 bp auseinander um ein spezifisches Cas9-vermitteltes "Double Nicking" der genomischen DNA zu erlauben und so im Resultat den Effekt eines Doppelstrangbruchs nachzuahmen.
  • Ein Plasmid kodiert für ein Puromycin-Resistenzgen zur Selektion von stabilen Knockout-Zellen. Das andere Plasmid kodiert für ein GFP-Gen für den visuellen Nachweis der Transfektion
  • PB1 Double-Nickase-Plasmid (m) und PB1 Double-Nickase-Plasmid (m2) kodieren unterschiedliche gepaarte gRNA-Designs, die auf Pbrm1 abzielen. Möglicherweise ist eines oder sind beide Designs verfügbar
  • Nach der Transfektion kann die Effizienz des Gen-Knockouts per Western Blot oder histologisch mit folgendem Antikörper überprüft werden: PB1: sc-390095
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    PB1 Double Nickase Plasmid (m)

    sc-426270-NIC
    20 µg
    $410.00

    PB1 Double Nickase Plasmid (m2)

    sc-426270-NIC-2
    20 µg
    $410.00

    Mouse Pbrm1 kodiert PB1 (auch bekannt als PBRM1/BAF180), eine charakteristische Untereinheit des PBAF‑SWI/SNF‑Chromatin-Remodeling-Komplexes, die über multiple Bromodomänen acetylierte Histone erkennt und zur Positionierung von Nukleosomen beiträgt, um die Transkription zu regulieren. PB1 beeinflusst die Kommunikation zwischen Enhancer und Promotor, DNA-Schadensantworten und linien-/zelltypspezifische Differenzierungsprogramme, indem es die Chromatinzugänglichkeit mit der Bindung von Transkriptionsfaktoren koordiniert. Der Verlust oder die Störung von Pbrm1 beeinträchtigt die epigenetische Kontrolle von Zellzyklus- und Stressantwort-Netzwerken und wird häufig im Kontext der Tumorsuppressorbiologie, der Genomstabilität und entzündlicher Signalwege untersucht. In Mausmodellen wird Pbrm1 breit eingesetzt, um zu untersuchen, wie Chromatin-Remodeler Immunmikroumgebungen, metabolische Anpassung und Entwicklungsphänotypen prägen.

    PB1 Das Double-Nickase-Plasmid (m) besteht aus einem aufeinander abgestimmten Plasmidpaar, das für die hochspezifische Bearbeitung des Pbrm1-Lokus in mouse-Zelllinien entwickelt wurde. Jedes Plasmid exprimiert eine Cas9-D10A-Nickase und eine spezifische sgRNA, die auf entgegengesetzte DNA-Stränge innerhalb von Pbrm1 abzielt. Wenn sie auf benachbarte Stellen auf entgegengesetzten DNA-Strängen gerichtet sind, erzeugen die beiden Nickasen versetzte Einzelstrang-Schnitte, die zusammen einen versetzten Doppelstrangbruch erzeugen, was eine koordinierte On-Target-Aktivität beider Guides erfordert. Der resultierende DNA-Bruch wird durch endogene zelluläre Reparaturwege behoben, meist durch nicht-homologe Endverknüpfung (NHEJ), was zu Insertionen oder Deletionen führt, die die Pbrm1-Funktion stören. Durch die Notwendigkeit einer doppelten sgRNA-Bindung am Zielort erhöht der Doppel-Nick-Ansatz die Spezifität der Bearbeitung und bietet eine komplementäre CRISPR-Strategie für Anwendungen, bei denen eine zusätzliche Kontrolle über die Zielgenauigkeit gewünscht ist.

    Um eine effiziente Identifizierung editierter Zellen zu unterstützen, kodiert ein Plasmid GFP zur fluoreszierenden Visualisierung transfizierter Populationen, während das Begleitplasmid ein Puromycin-Resistenzgen für die Antibiotika-Selektion trägt. Zusammen unterstützen diese Merkmale eine effiziente Anreicherung co-transfizierter Populationen und vereinfachen die Validierung von Klonen mit Pbrm1-Störung.

    Nur für Forschungszwecke. Nicht für diagnostische oder therapeutische Zwecke bestimmt.