OTUD2 Double Nickase Plasmid (m): sc-432624-NIC
- Zielspezies: mouse
- 20 µg transfektionsfertige, aufgereinigte Plasmid DNA; geeignet für 20 Transfektionen
- Das OTUD2 Double Nickase Plasmid (m) wird als Plasmid-Paar geliefert. Die einzelnen Plasmide kodieren für eine D10A mutierte Cas9 Nuklease sowie für je eine unterschiedliche, zielspezifische 20nt guide RNA (gRNA) Sequenz. Dies erlaubt eine hohe Knockout-Effizienz bei gleichzeitig größerer Spezifität als das entsprechende CRISPR/Cas9 KO Plasmid
- gRNA Sequenzpaare liegen ca. 20 bp auseinander um ein spezifisches Cas9-vermitteltes "Double Nicking" der genomischen DNA zu erlauben und so im Resultat den Effekt eines Doppelstrangbruchs nachzuahmen.
- Ein Plasmid kodiert für ein Puromycin-Resistenzgen zur Selektion von stabilen Knockout-Zellen. Das andere Plasmid kodiert für ein GFP-Gen für den visuellen Nachweis der Transfektion
- OTUD2 Double-Nickase-Plasmid (m) und OTUD2 Double-Nickase-Plasmid (m2) kodieren unterschiedliche gepaarte gRNA-Designs, die auf Yod1 abzielen. Möglicherweise ist eines oder sind beide Designs verfügbar
Bestellinformation
| Produkt | Katalog # | EINHEIT | Preis | ANZAHL | Favoriten | |
OTUD2 Double Nickase Plasmid (m) | sc-432624-NIC | 20 µg | $410.00 | |||
OTUD2 Double Nickase Plasmid (m2) | sc-432624-NIC-2 | 20 µg | $410.00 |
Das Mausgen **Yod1** kodiert **OTUD2**, eine Deubiquitinase der Ovarian‑Tumor‑(OTU-)Familie, die Ubiquitin-Ketten umgestaltet, um Protein-stabilität und Signaltransduktion zu modulieren. OTUD2 ist an der ubiquitinabhängigen Kontrolle der Proteostase sowie an der angeborenen Immun- und Entzündungssignalgebung beteiligt und verknüpft damit Deubiquitinierung mit der Feinabstimmung von Signalwegen und zellulären Stressantworten. Eine dysregulierte Ubiquitin-Editierung und OTU-Deubiquitinase-Aktivität werden häufig mit veränderten Outputs der NF-κB- und Interferon-Signalwege in Verbindung gebracht, was für Studien zur Infektionsbiologie, Entzündung und tumorassoziierten Signalgebung relevant ist. Eine Störung von Yod1/OTUD2 ist daher nützlich, um Ubiquitin-Ketten-Remodeling, Qualitätskontrolle und kontextspezifische Signaldynamik in Maus-Zellen zu untersuchen.
OTUD2 Das Double-Nickase-Plasmid (m) besteht aus einem aufeinander abgestimmten Plasmidpaar, das für die hochspezifische Bearbeitung des Yod1-Lokus in mouse-Zelllinien entwickelt wurde. Jedes Plasmid exprimiert eine Cas9-D10A-Nickase und eine spezifische sgRNA, die auf entgegengesetzte DNA-Stränge innerhalb von Yod1 abzielt. Wenn sie auf benachbarte Stellen auf entgegengesetzten DNA-Strängen gerichtet sind, erzeugen die beiden Nickasen versetzte Einzelstrang-Schnitte, die zusammen einen versetzten Doppelstrangbruch erzeugen, was eine koordinierte On-Target-Aktivität beider Guides erfordert. Der resultierende DNA-Bruch wird durch endogene zelluläre Reparaturwege behoben, meist durch nicht-homologe Endverknüpfung (NHEJ), was zu Insertionen oder Deletionen führt, die die Yod1-Funktion stören. Durch die Notwendigkeit einer doppelten sgRNA-Bindung am Zielort erhöht der Doppel-Nick-Ansatz die Spezifität der Bearbeitung und bietet eine komplementäre CRISPR-Strategie für Anwendungen, bei denen eine zusätzliche Kontrolle über die Zielgenauigkeit gewünscht ist.
Um eine effiziente Identifizierung editierter Zellen zu unterstützen, kodiert ein Plasmid GFP zur fluoreszierenden Visualisierung transfizierter Populationen, während das Begleitplasmid ein Puromycin-Resistenzgen für die Antibiotika-Selektion trägt. Zusammen unterstützen diese Merkmale eine effiziente Anreicherung co-transfizierter Populationen und vereinfachen die Validierung von Klonen mit Yod1-Störung.
Nur für Forschungszwecke. Nicht für diagnostische oder therapeutische Zwecke bestimmt.