Date published: 2025-9-6

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Oct-1 Gel Shift Oligonucleotides: sc-2506

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Datenblätter
  • consensus binding site for Oct family homeodomain transcription factors; supplied as 500 ng double-stranded DNA; sc-2506
  • also available as mutant oligonucleotide with an "AT"→"GC" substitution in Oct DNA binding motif; sc-2515
  • 5′-TGT CGA ATG CAA ATC ACT AGA A-3′

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Oct-1-Gel-Shift-Oligonukleotide sind kurze DNA-Sequenzen, die für die Verwendung in Gel-Shift-Assays entwickelt wurden, einer grundlegenden Technik in der Molekularbiologie, die zur Untersuchung von Protein-DNA-Interaktionen eingesetzt wird. Diese Oligonukleotide sind von der Konsensus-Bindungssequenz des Transkriptionsfaktors Oct-1 abgeleitet, der zur POU (Pit-Oct-Unc)-Domänenfamilie der Transkriptionsfaktoren gehört. Oct-1 spielt eine entscheidende Rolle bei der Regulierung der Genexpression, indem er an spezifische DNA-Sequenzen, so genannte Octamer-Motive, bindet, die sich in den Promotoren der Zielgene befinden. Nach der Bindung an seine Zielstellen kann Oct-1 die Gentranskription je nach Kontext und Interaktion mit anderen regulatorischen Proteinen entweder aktivieren oder unterdrücken. Durch die Verwendung von Oct-1-Gel-Shift-Oligonukleotiden in Gel-Shift-Assays können Forscher die Bindungskinetik, Spezifität und Affinität von Oct-1 zu Octamer-Motiven unter verschiedenen Versuchsbedingungen untersuchen. Diese Technik ermöglicht die Aufklärung der molekularen Mechanismen, die der Oct-1-vermittelten Genregulierung zugrunde liegen, und bietet Einblicke in die komplexen Signalnetzwerke, die zelluläre Prozesse wie Entwicklung, Differenzierung und Proliferation steuern.

Literaturhinweise:

  1. Der Octamer-Transkriptionsfaktor-1 verstärkt die durch den hepatischen Nuklearfaktor-1alpha vermittelte Aktivierung des Promotors der menschlichen UDP-Glucuronosyltransferase 2B7.  |  Ishii, Y., et al. 2000. Mol Pharmacol. 57: 940-7. PMID: 10779377
  2. Allel-spezifische Bindung des ubiquitären Transkriptionsfaktors OCT-1 an die funktionellen Einzelnukleotid-Polymorphismus (SNP)-Stellen im Tumor-Nekrose-Faktor-alpha-Gen (TNFA)-Promoter.  |  Hohjoh, H. and Tokunaga, K. 2001. Genes Immun. 2: 105-9. PMID: 11393654
  3. Bindung von Octamer-Faktoren an das murine IL-5 CLE0 in primären T-Zellen und einer T-Zelllinie.  |  Salerno, MS., et al. 2001. Cytokine. 15: 4-9. PMID: 11509003
  4. 3-Hydroxy-3-methylglutaryl-Coenzym-A-Reduktase-Inhibitoren erhöhen die Bindungsaktivität und den Kernbestand von Oct-1 in mononukleären Zellen.  |  Ortego, M., et al. 2002. Eur J Pharmacol. 448: 113-21. PMID: 12144930
  5. Beteiligung von Oct-1 an der Transkriptionsregulierung der Beta-Kasein-Genexpression in der Brustdrüse der Maus.  |  Zhao, FQ., et al. 2002. Biochim Biophys Acta. 1577: 27-37. PMID: 12151092
  6. TALE-Homeodomain-Proteine regulieren die Genexpression des Gonadotropin-Releasing-Hormons unabhängig und über Interaktionen mit Oct-1.  |  Rave-Harel, N., et al. 2004. J Biol Chem. 279: 30287-97. PMID: 15138251
  7. Oct-1 und der Nuklearfaktor Y binden an das SURG-1-Element, um die basale und durch Gonadotropin-Releasing-Hormon (GnRH) stimulierte Gentranskription des GnRH-Rezeptors der Maus zu steuern.  |  Kam, KY., et al. 2005. Mol Endocrinol. 19: 148-62. PMID: 15388790
  8. Triptolid, ein aktiver Bestandteil des chinesischen pflanzlichen Heilmittels Tripterygium wilfordii Hook F, hemmt die Produktion von Stickstoffmonoxid, indem es die Gentranskription der induzierbaren Stickstoffmonoxid-Synthase verringert.  |  Wang, B., et al. 2004. Arthritis Rheum. 50: 2995-303. PMID: 15457469
  9. Regulierung des CYP4A2-Genpromotors der Ratte durch c-Jun und Octamer-Bindungsprotein-1.  |  Fiala-Beer, E., et al. 2007. Int J Biochem Cell Biol. 39: 1235-47. PMID: 17481938
  10. Zusammenhang zwischen der Serum-Interleukin-6-Konzentration und einem funktionellen IL6 -6331T>C-Polymorphismus.  |  Smith, AJ., et al. 2008. Clin Chem. 54: 841-50. PMID: 18356242
  11. Lamin B1 steuert oxidative Stressreaktionen über Oct-1.  |  Malhas, AN., et al. 2009. J Cell Biol. 184: 45-55. PMID: 19139261
  12. Ein stromaufwärts gelegenes Oct-1-Motiv reguliert die durch Zytokine induzierte Transkription des menschlichen Gens der induzierbaren Stickoxid-Synthase.  |  Park, KS., et al. 2009. J Mol Biol. 390: 595-603. PMID: 19467240
  13. Die Transkriptionsaktivität des Enhancers des humanen Papillomavirus Typ 31b wird durch eine synergistische Interaktion von AP1 mit zwei neuen zellulären Faktoren reguliert.  |  Kyo, S., et al. 1995. Virology. 211: 184-97. PMID: 7645210
  14. Oct-1 bindet Promotorelemente, die für die Transkription des GnRH-Gens erforderlich sind.  |  Eraly, SA., et al. 1998. Mol Endocrinol. 12: 469-81. PMID: 9544983

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Oct-1 consensus oligonucleotide

sc-2506
500 ng/25 µl
$49.00

Oct-1 mutant oligonucleotide

sc-2515
500 ng/25 µl
$49.00