Not CRISPR data: the image illustrates antibody quality for visualizing CRISPR experiment results.
Not CRISPR data: the image illustrates antibody quality for visualizing CRISPR experiment results.
NY-ESO-1 Double Nickase Plasmid (h): sc-418340-NIC
- Zielspezies: human
- 20 µg transfektionsfertige, aufgereinigte Plasmid DNA; geeignet für 20 Transfektionen
- Das NY-ESO-1 Double Nickase Plasmid (h) wird als Plasmid-Paar geliefert. Die einzelnen Plasmide kodieren für eine D10A mutierte Cas9 Nuklease sowie für je eine unterschiedliche, zielspezifische 20nt guide RNA (gRNA) Sequenz. Dies erlaubt eine hohe Knockout-Effizienz bei gleichzeitig größerer Spezifität als das entsprechende CRISPR/Cas9 KO Plasmid
- gRNA Sequenzpaare liegen ca. 20 bp auseinander um ein spezifisches Cas9-vermitteltes "Double Nicking" der genomischen DNA zu erlauben und so im Resultat den Effekt eines Doppelstrangbruchs nachzuahmen.
- Ein Plasmid kodiert für ein Puromycin-Resistenzgen zur Selektion von stabilen Knockout-Zellen. Das andere Plasmid kodiert für ein GFP-Gen für den visuellen Nachweis der Transfektion
- NY-ESO-1 Double-Nickase-Plasmid (h) und NY-ESO-1 Double-Nickase-Plasmid (h2) kodieren unterschiedliche gepaarte gRNA-Designs, die auf CTAG1B abzielen. Möglicherweise ist eines oder sind beide Designs verfügbar
- Nach der Transfektion kann die Effizienz des Gen-Knockouts per Western Blot oder histologisch mit folgendem Antikörper überprüft werden: NY-ESO-1: sc-53869
Bestellinformation
| Produkt | Katalog # | EINHEIT | Preis | ANZAHL | Favoriten | |
NY-ESO-1 Double Nickase Plasmid (h) | sc-418340-NIC | 20 µg | $410.00 | |||
NY-ESO-1 Double Nickase Plasmid (h2) | sc-418340-NIC-2 | 20 µg | $410.00 |
CTAG1B kodiert NY-ESO-1, ein Krebs-/Hoden-Antigen mit stark eingeschränkter Expression in normalen adulten Geweben und häufiger ektope Expression in zahlreichen Tumorarten. Aus NY-ESO-1 abgeleitete Peptide werden durch das Proteasom prozessiert und auf MHC-Klasse-I- und -II-Komplexen präsentiert, wodurch die CTAG1B-Expression mit Signalwegen der Antigenprozessierung und -präsentation sowie der Tumorimmunogenität verknüpft ist. Seine Expression ist häufig mit epigenetischer Dysregulation assoziiert, darunter DNA-Hypomethylierung und Chromatin-Remodelling, und wird als Marker zur Untersuchung von Reaktivierungsprogrammen keimbahnspezifischer Gene bei Malignomen verwendet. Die CTAG1B/NY-ESO-1-Forschung unterstützt Untersuchungen zur transkriptionellen Kontrolle, zu Mechanismen der Immunerkennung und zu zellulären Phänotypen, die mit der Expression tumorgebundener Antigene einhergehen.
NY-ESO-1 Das Double-Nickase-Plasmid (h) besteht aus einem aufeinander abgestimmten Plasmidpaar, das für die hochspezifische Bearbeitung des CTAG1B-Lokus in human-Zelllinien entwickelt wurde. Jedes Plasmid exprimiert eine Cas9-D10A-Nickase und eine spezifische sgRNA, die auf entgegengesetzte DNA-Stränge innerhalb von CTAG1B abzielt. Wenn sie auf benachbarte Stellen auf entgegengesetzten DNA-Strängen gerichtet sind, erzeugen die beiden Nickasen versetzte Einzelstrang-Schnitte, die zusammen einen versetzten Doppelstrangbruch erzeugen, was eine koordinierte On-Target-Aktivität beider Guides erfordert. Der resultierende DNA-Bruch wird durch endogene zelluläre Reparaturwege behoben, meist durch nicht-homologe Endverknüpfung (NHEJ), was zu Insertionen oder Deletionen führt, die die CTAG1B-Funktion stören. Durch die Notwendigkeit einer doppelten sgRNA-Bindung am Zielort erhöht der Doppel-Nick-Ansatz die Spezifität der Bearbeitung und bietet eine komplementäre CRISPR-Strategie für Anwendungen, bei denen eine zusätzliche Kontrolle über die Zielgenauigkeit gewünscht ist.
Um eine effiziente Identifizierung editierter Zellen zu unterstützen, kodiert ein Plasmid GFP zur fluoreszierenden Visualisierung transfizierter Populationen, während das Begleitplasmid ein Puromycin-Resistenzgen für die Antibiotika-Selektion trägt. Zusammen unterstützen diese Merkmale eine effiziente Anreicherung co-transfizierter Populationen und vereinfachen die Validierung von Klonen mit CTAG1B-Störung.
Nur für Forschungszwecke. Nicht für diagnostische oder therapeutische Zwecke bestimmt.